Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL28Q13084 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL28Q13084 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL28Q13084 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL28Q13084 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL28Q13084 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL28Q13084 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL28Q13084 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL28Q13084 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL28Q13084 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL28Q13084 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL28Q13084 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL28Q13084 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL28Q13084 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL28Q13084 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL28Q13084 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL28Q13084 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL28Q13084 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL28Q13084 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL28Q13084 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL28Q13084 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL28Q13084 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL28Q13084 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL28Q13084 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL28Q13084 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL28Q13084 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL28Q13084 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL28Q13084 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL28Q13084 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL28Q13084 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL28Q13084 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL28Q13084 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL28Q13084 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL28Q13084 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL28Q13084 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL28Q13084 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL28Q13084 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL28Q13084 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL28Q13084 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL28Q13084 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL28Q13084 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL28Q13084 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL28Q13084 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL28Q13084 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL28Q13084 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL28Q13084 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MRPL28Q13084 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL28Q13084 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL28Q13084 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL28Q13084 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL28Q13084 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL28Q13084 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL28Q13084 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL28Q13084 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL28Q13084 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL28Q13084 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL28Q13084 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL28Q13084 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL28Q13084 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL28Q13084 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL28Q13084 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL28Q13084 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL28Q13084 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL28Q13084 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL28Q13084 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL28Q13084 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL28Q13084 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL28Q13084 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL28Q13084 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL28Q13084 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL28Q13084 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL28Q13084 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MRPL28Q13084 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL28Q13084 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL28Q13084 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL28Q13084 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL28Q13084 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL28Q13084 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL28Q13084 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL28Q13084 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL28Q13084 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL28Q13084 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL28Q13084 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL28Q13084 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL28Q13084 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL28Q13084 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL28Q13084 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL28Q13084 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL28Q13084 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL28Q13084 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL28Q13084 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL28Q13084 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL28Q13084 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL28Q13084 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL28Q13084 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL28Q13084 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL28Q13084 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL28Q13084 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL28Q13084 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL28Q13084 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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