Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN13Q12923 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN13Q12923 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN13Q12923 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN13Q12923 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN13Q12923 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN13Q12923 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPN13Q12923 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPN13Q12923 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPN13Q12923 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPN13Q12923 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPN13Q12923 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN13Q12923 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN13Q12923 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN13Q12923 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN13Q12923 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN13Q12923 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN13Q12923 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN13Q12923 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN13Q12923 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN13Q12923 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN13Q12923 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN13Q12923 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN13Q12923 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN13Q12923 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN13Q12923 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN13Q12923 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN13Q12923 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN13Q12923 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN13Q12923 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN13Q12923 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN13Q12923 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN13Q12923 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN13Q12923 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN13Q12923 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN13Q12923 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN13Q12923 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN13Q12923 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN13Q12923 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN13Q12923 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPN13Q12923 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN13Q12923 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN13Q12923 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN13Q12923 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN13Q12923 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN13Q12923 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN13Q12923 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN13Q12923 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN13Q12923 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN13Q12923 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN13Q12923 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN13Q12923 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN13Q12923 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN13Q12923 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN13Q12923 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN13Q12923 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN13Q12923 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN13Q12923 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN13Q12923 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN13Q12923 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN13Q12923 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN13Q12923 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN13Q12923 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN13Q12923 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN13Q12923 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN13Q12923 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN13Q12923 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN13Q12923 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN13Q12923 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN13Q12923 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN13Q12923 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN13Q12923 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN13Q12923 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN13Q12923 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN13Q12923 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN13Q12923 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN13Q12923 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN13Q12923 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN13Q12923 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN13Q12923 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN13Q12923 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN13Q12923 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN13Q12923 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN13Q12923 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN13Q12923 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN13Q12923 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN13Q12923 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN13Q12923 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN13Q12923 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN13Q12923 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN13Q12923 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN13Q12923 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN13Q12923 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN13Q12923 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN13Q12923 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN13Q12923 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN13Q12923 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN13Q12923 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN13Q12923 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN13Q12923 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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