Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF3C1Q12789 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF3C1Q12789 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C1Q12789 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C1Q12789 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C1Q12789 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C1Q12789 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF3C1Q12789 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF3C1Q12789 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF3C1Q12789 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF3C1Q12789 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF3C1Q12789 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF3C1Q12789 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF3C1Q12789 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF3C1Q12789 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C1Q12789 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C1Q12789 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C1Q12789 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C1Q12789 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C1Q12789 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C1Q12789 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C1Q12789 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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