Protein–RNA interactions for Protein: Q12507

SFG1, Superficial pseudohyphal growth protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SFG1Q12507 YMR007WYMR007W 381 nt7.48□□□□□ -1.21
SFG1Q12507 AAC3YBR085W 924 nt7.48□□□□□ -1.21
SFG1Q12507 HTS1YPR033C 1641 nt7.48□□□□□ -1.21
SFG1Q12507 ENO1YGR254W 1314 nt7.48□□□□□ -1.21
SFG1Q12507 NAM8YHR086W 1572 nt7.47□□□□□ -1.21
SFG1Q12507 YHR131CYHR131C 2553 nt7.47□□□□□ -1.21
SFG1Q12507 YJL009WYJL009W 327 nt7.47□□□□□ -1.21
SFG1Q12507 SRP102YKL154W 735 nt7.47□□□□□ -1.21
SFG1Q12507 YLR173WYLR173W 1827 nt7.47□□□□□ -1.21
SFG1Q12507 HSV2YGR223C 1347 nt7.47□□□□□ -1.21
SFG1Q12507 YLR072WYLR072W 2082 nt7.47□□□□□ -1.21
SFG1Q12507 SER2YGR208W 930 nt7.46□□□□□ -1.22
SFG1Q12507 MDH2YOL126C 1134 nt7.46□□□□□ -1.22
SFG1Q12507 SRP54YPR088C 1626 nt7.45□□□□□ -1.22
SFG1Q12507 REX2YLR059C 810 nt7.45□□□□□ -1.22
SFG1Q12507 ERG6YML008C 1152 nt7.45□□□□□ -1.22
SFG1Q12507 LPD1YFL018C 1500 nt7.45□□□□□ -1.22
SFG1Q12507 GAS1YMR307W 1680 nt7.44□□□□□ -1.22
SFG1Q12507 SWM1YDR260C 513 nt7.44□□□□□ -1.22
SFG1Q12507 YPT11YNL304W 1254 nt7.44□□□□□ -1.22
SFG1Q12507 HIS3YOR202W 663 nt7.44□□□□□ -1.22
SFG1Q12507 SDS24YBR214W 1584 nt7.44□□□□□ -1.22
SFG1Q12507 TMS1YDR105C 1422 nt7.44□□□□□ -1.22
SFG1Q12507 LYS20YDL182W 1287 nt7.43□□□□□ -1.22
SFG1Q12507 NSG2YNL156C 900 nt7.43□□□□□ -1.22
SFG1Q12507 PTC6YCR079W 1329 nt7.43□□□□□ -1.22
SFG1Q12507 SLM3YDL033C 1254 nt7.41□□□□□ -1.22
SFG1Q12507 ECM27YJR106W 2178 nt7.4□□□□□ -1.23
SFG1Q12507 CBK1YNL161W 2271 nt7.39□□□□□ -1.23
SFG1Q12507 ABP1YCR088W 1779 nt7.39□□□□□ -1.23
SFG1Q12507 NDE2YDL085W 1638 nt7.38□□□□□ -1.23
SFG1Q12507 VBA3YCL069W 1377 nt7.38□□□□□ -1.23
SFG1Q12507 YLR280CYLR280C 351 nt7.38□□□□□ -1.23
SFG1Q12507 ERO1YML130C 1692 nt7.38□□□□□ -1.23
SFG1Q12507 RSM7YJR113C 744 nt7.37□□□□□ -1.23
SFG1Q12507 TIF3YPR163C 1311 nt7.36□□□□□ -1.23
SFG1Q12507 YNL140CYNL140C 570 nt7.36□□□□□ -1.23
SFG1Q12507 YGR210CYGR210C 1236 nt7.34□□□□□ -1.23
SFG1Q12507 YJR149WYJR149W 1215 nt7.34□□□□□ -1.23
SFG1Q12507 SNU66YOR308C 1764 nt7.33□□□□□ -1.24
SFG1Q12507 MET30YIL046W 1923 nt7.33□□□□□ -1.24
SFG1Q12507 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.33□□□□□ -1.24
SFG1Q12507 BUB2YMR055C 921 nt7.33□□□□□ -1.24
SFG1Q12507 NME1NME1 340 nt7.33□□□□□ -1.24
SFG1Q12507 TOM71YHR117W 1920 nt7.33□□□□□ -1.24
SFG1Q12507 MEP1YGR121C 1479 nt7.32□□□□□ -1.24
SFG1Q12507 YIR035CYIR035C 765 nt7.32□□□□□ -1.24
SFG1Q12507 INO1YJL153C 1602 nt7.31□□□□□ -1.24
SFG1Q12507 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.31□□□□□ -1.24
SFG1Q12507 YFR020WYFR020W 699 nt7.31□□□□□ -1.24
SFG1Q12507 YNL190WYNL190W 615 nt7.31□□□□□ -1.24
SFG1Q12507 YBR056WYBR056W 1506 nt7.31□□□□□ -1.24
SFG1Q12507 NAS6YGR232W 687 nt7.3□□□□□ -1.24
SFG1Q12507 INM1YHR046C 888 nt7.3□□□□□ -1.24
SFG1Q12507 YLR460CYLR460C 1131 nt7.3□□□□□ -1.24
SFG1Q12507 YPL108WYPL108W 507 nt7.3□□□□□ -1.24
SFG1Q12507 YPL264CYPL264C 1062 nt7.3□□□□□ -1.24
SFG1Q12507 FCY1YPR062W 477 nt7.3□□□□□ -1.24
SFG1Q12507 BUD31YCR063W 474 nt7.29□□□□□ -1.24
SFG1Q12507 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.29□□□□□ -1.24
SFG1Q12507 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.29□□□□□ -1.24
SFG1Q12507 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.29□□□□□ -1.24
SFG1Q12507 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.29□□□□□ -1.24
SFG1Q12507 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.29□□□□□ -1.24
SFG1Q12507 AIM34YMR003W 597 nt7.29□□□□□ -1.24
SFG1Q12507 PMT7YDR307W 1989 nt7.29□□□□□ -1.24
SFG1Q12507 PAB1YER165W 1734 nt7.28□□□□□ -1.24
SFG1Q12507 TGL5YOR081C 2250 nt7.28□□□□□ -1.24
SFG1Q12507 GLY1YEL046C 1164 nt7.27□□□□□ -1.25
SFG1Q12507 YMR166CYMR166C 1107 nt7.26□□□□□ -1.25
SFG1Q12507 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.25□□□□□ -1.25
SFG1Q12507 RRT6YGL146C 936 nt7.25□□□□□ -1.25
SFG1Q12507 TDA4YJR116W 840 nt7.25□□□□□ -1.25
SFG1Q12507 MGM101YJR144W 810 nt7.25□□□□□ -1.25
SFG1Q12507 BUD20YLR074C 501 nt7.25□□□□□ -1.25
SFG1Q12507 SPE4YLR146C 903 nt7.25□□□□□ -1.25
SFG1Q12507 RTG2YGL252C 1767 nt7.25□□□□□ -1.25
SFG1Q12507 CHS7YHR142W 951 nt7.24□□□□□ -1.25
SFG1Q12507 MLS1YNL117W 1665 nt7.23□□□□□ -1.25
SFG1Q12507 WSC4YHL028W 1818 nt7.23□□□□□ -1.25
SFG1Q12507 CHA1YCL064C 1083 nt7.23□□□□□ -1.25
SFG1Q12507 HRA1HRA1 564 nt7.23□□□□□ -1.25
SFG1Q12507 ATP10YLR393W 840 nt7.23□□□□□ -1.25
SFG1Q12507 PRC1YMR297W 1599 nt7.23□□□□□ -1.25
SFG1Q12507 MRN1YPL184C 1839 nt7.22□□□□□ -1.25
SFG1Q12507 YOR343CYOR343C 327 nt7.22□□□□□ -1.25
SFG1Q12507 KTR4YBR199W 1395 nt7.21□□□□□ -1.25
SFG1Q12507 ADE2YOR128C 1716 nt7.21□□□□□ -1.25
SFG1Q12507 ITR1YDR497C 1755 nt7.21□□□□□ -1.25
SFG1Q12507 RRT14YIL127C 621 nt7.21□□□□□ -1.26
SFG1Q12507 UBP13YBL067C 2244 nt7.21□□□□□ -1.26
SFG1Q12507 BEM1YBR200W 1656 nt7.2□□□□□ -1.26
SFG1Q12507 RPL12BYDR418W 498 nt7.2□□□□□ -1.26
SFG1Q12507 GRH1YDR517W 1119 nt7.2□□□□□ -1.26
SFG1Q12507 YGR137WYGR137W 375 nt7.2□□□□□ -1.26
SFG1Q12507 YJL160CYJL160C 864 nt7.2□□□□□ -1.26
SFG1Q12507 OLA1YBR025C 1185 nt7.2□□□□□ -1.26
SFG1Q12507 LSP1YPL004C 1026 nt7.2□□□□□ -1.26
SFG1Q12507 MRP7YNL005C 1116 nt7.19□□□□□ -1.26
SFG1Q12507 PAU21YOR394W 495 nt7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.5 ms