Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYCNQ0VAF6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYCNQ0VAF6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYCNQ0VAF6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYCNQ0VAF6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCNQ0VAF6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCNQ0VAF6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCNQ0VAF6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCNQ0VAF6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCNQ0VAF6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCNQ0VAF6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCNQ0VAF6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCNQ0VAF6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCNQ0VAF6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCNQ0VAF6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCNQ0VAF6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCNQ0VAF6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCNQ0VAF6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCNQ0VAF6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCNQ0VAF6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCNQ0VAF6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCNQ0VAF6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCNQ0VAF6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCNQ0VAF6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCNQ0VAF6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCNQ0VAF6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCNQ0VAF6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYCNQ0VAF6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYCNQ0VAF6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYCNQ0VAF6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYCNQ0VAF6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYCNQ0VAF6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYCNQ0VAF6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYCNQ0VAF6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYCNQ0VAF6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYCNQ0VAF6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCNQ0VAF6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCNQ0VAF6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms