Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSM1Q08AH1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSM1Q08AH1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSM1Q08AH1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSM1Q08AH1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSM1Q08AH1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSM1Q08AH1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSM1Q08AH1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSM1Q08AH1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSM1Q08AH1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSM1Q08AH1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSM1Q08AH1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSM1Q08AH1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSM1Q08AH1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSM1Q08AH1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSM1Q08AH1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSM1Q08AH1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSM1Q08AH1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSM1Q08AH1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSM1Q08AH1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSM1Q08AH1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSM1Q08AH1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSM1Q08AH1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSM1Q08AH1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSM1Q08AH1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSM1Q08AH1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSM1Q08AH1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSM1Q08AH1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSM1Q08AH1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSM1Q08AH1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSM1Q08AH1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSM1Q08AH1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSM1Q08AH1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSM1Q08AH1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSM1Q08AH1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSM1Q08AH1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSM1Q08AH1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSM1Q08AH1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSM1Q08AH1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSM1Q08AH1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSM1Q08AH1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSM1Q08AH1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSM1Q08AH1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSM1Q08AH1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSM1Q08AH1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSM1Q08AH1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSM1Q08AH1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACSM1Q08AH1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACSM1Q08AH1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACSM1Q08AH1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSM1Q08AH1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSM1Q08AH1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSM1Q08AH1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSM1Q08AH1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSM1Q08AH1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSM1Q08AH1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSM1Q08AH1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSM1Q08AH1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSM1Q08AH1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSM1Q08AH1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSM1Q08AH1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSM1Q08AH1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSM1Q08AH1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSM1Q08AH1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSM1Q08AH1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSM1Q08AH1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSM1Q08AH1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSM1Q08AH1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSM1Q08AH1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSM1Q08AH1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSM1Q08AH1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSM1Q08AH1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSM1Q08AH1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSM1Q08AH1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSM1Q08AH1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSM1Q08AH1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSM1Q08AH1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACSM1Q08AH1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACSM1Q08AH1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSM1Q08AH1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSM1Q08AH1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSM1Q08AH1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSM1Q08AH1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSM1Q08AH1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSM1Q08AH1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSM1Q08AH1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSM1Q08AH1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSM1Q08AH1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSM1Q08AH1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSM1Q08AH1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSM1Q08AH1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSM1Q08AH1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSM1Q08AH1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSM1Q08AH1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSM1Q08AH1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSM1Q08AH1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSM1Q08AH1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSM1Q08AH1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSM1Q08AH1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSM1Q08AH1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms