Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDE4DQ08499 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDE4DQ08499 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDE4DQ08499 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDE4DQ08499 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDE4DQ08499 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDE4DQ08499 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDE4DQ08499 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDE4DQ08499 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDE4DQ08499 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDE4DQ08499 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDE4DQ08499 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDE4DQ08499 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PDE4DQ08499 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDE4DQ08499 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PDE4DQ08499 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDE4DQ08499 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDE4DQ08499 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PDE4DQ08499 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDE4DQ08499 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDE4DQ08499 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDE4DQ08499 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDE4DQ08499 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDE4DQ08499 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDE4DQ08499 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDE4DQ08499 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDE4DQ08499 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PDE4DQ08499 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PDE4DQ08499 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PDE4DQ08499 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PDE4DQ08499 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PDE4DQ08499 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PDE4DQ08499 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PDE4DQ08499 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PDE4DQ08499 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDE4DQ08499 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDE4DQ08499 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDE4DQ08499 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PDE4DQ08499 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PDE4DQ08499 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PDE4DQ08499 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PDE4DQ08499 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PDE4DQ08499 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PDE4DQ08499 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PDE4DQ08499 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDE4DQ08499 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDE4DQ08499 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDE4DQ08499 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PDE4DQ08499 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PDE4DQ08499 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDE4DQ08499 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDE4DQ08499 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDE4DQ08499 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDE4DQ08499 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDE4DQ08499 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDE4DQ08499 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDE4DQ08499 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDE4DQ08499 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDE4DQ08499 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDE4DQ08499 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PDE4DQ08499 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDE4DQ08499 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDE4DQ08499 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDE4DQ08499 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PDE4DQ08499 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDE4DQ08499 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDE4DQ08499 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDE4DQ08499 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDE4DQ08499 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDE4DQ08499 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDE4DQ08499 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDE4DQ08499 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDE4DQ08499 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDE4DQ08499 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDE4DQ08499 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDE4DQ08499 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDE4DQ08499 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDE4DQ08499 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDE4DQ08499 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDE4DQ08499 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDE4DQ08499 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDE4DQ08499 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDE4DQ08499 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDE4DQ08499 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDE4DQ08499 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE4DQ08499 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDE4DQ08499 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDE4DQ08499 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDE4DQ08499 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDE4DQ08499 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDE4DQ08499 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDE4DQ08499 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDE4DQ08499 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDE4DQ08499 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDE4DQ08499 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDE4DQ08499 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDE4DQ08499 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDE4DQ08499 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE4DQ08499 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE4DQ08499 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms