Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKCDQ05655 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKCDQ05655 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKCDQ05655 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKCDQ05655 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKCDQ05655 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRKCDQ05655 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCDQ05655 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCDQ05655 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCDQ05655 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCDQ05655 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCDQ05655 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCDQ05655 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCDQ05655 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCDQ05655 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCDQ05655 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCDQ05655 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCDQ05655 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCDQ05655 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCDQ05655 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCDQ05655 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCDQ05655 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCDQ05655 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCDQ05655 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCDQ05655 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCDQ05655 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCDQ05655 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCDQ05655 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCDQ05655 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCDQ05655 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCDQ05655 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCDQ05655 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCDQ05655 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCDQ05655 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCDQ05655 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCDQ05655 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCDQ05655 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCDQ05655 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKCDQ05655 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKCDQ05655 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKCDQ05655 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKCDQ05655 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKCDQ05655 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKCDQ05655 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCDQ05655 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCDQ05655 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCDQ05655 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCDQ05655 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCDQ05655 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCDQ05655 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCDQ05655 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCDQ05655 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCDQ05655 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCDQ05655 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCDQ05655 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCDQ05655 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCDQ05655 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCDQ05655 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCDQ05655 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCDQ05655 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCDQ05655 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCDQ05655 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCDQ05655 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCDQ05655 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCDQ05655 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCDQ05655 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCDQ05655 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRKCDQ05655 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRKCDQ05655 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRKCDQ05655 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCDQ05655 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKCDQ05655 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKCDQ05655 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKCDQ05655 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKCDQ05655 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKCDQ05655 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKCDQ05655 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKCDQ05655 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKCDQ05655 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKCDQ05655 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKCDQ05655 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKCDQ05655 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKCDQ05655 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKCDQ05655 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKCDQ05655 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKCDQ05655 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCDQ05655 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCDQ05655 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCDQ05655 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCDQ05655 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCDQ05655 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PRKCDQ05655 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCDQ05655 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCDQ05655 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCDQ05655 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCDQ05655 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCDQ05655 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCDQ05655 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCDQ05655 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCDQ05655 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms