Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RELAQ04206 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RELAQ04206 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RELAQ04206 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RELAQ04206 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RELAQ04206 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RELAQ04206 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RELAQ04206 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RELAQ04206 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RELAQ04206 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RELAQ04206 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RELAQ04206 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RELAQ04206 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RELAQ04206 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RELAQ04206 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RELAQ04206 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RELAQ04206 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RELAQ04206 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RELAQ04206 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RELAQ04206 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RELAQ04206 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RELAQ04206 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RELAQ04206 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RELAQ04206 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RELAQ04206 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RELAQ04206 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RELAQ04206 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RELAQ04206 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RELAQ04206 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RELAQ04206 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RELAQ04206 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RELAQ04206 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RELAQ04206 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RELAQ04206 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RELAQ04206 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RELAQ04206 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RELAQ04206 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RELAQ04206 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RELAQ04206 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RELAQ04206 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RELAQ04206 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RELAQ04206 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RELAQ04206 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RELAQ04206 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RELAQ04206 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RELAQ04206 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RELAQ04206 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RELAQ04206 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RELAQ04206 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RELAQ04206 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RELAQ04206 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RELAQ04206 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RELAQ04206 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RELAQ04206 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RELAQ04206 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RELAQ04206 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RELAQ04206 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RELAQ04206 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RELAQ04206 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RELAQ04206 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RELAQ04206 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RELAQ04206 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RELAQ04206 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RELAQ04206 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RELAQ04206 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RELAQ04206 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RELAQ04206 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RELAQ04206 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RELAQ04206 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RELAQ04206 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RELAQ04206 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RELAQ04206 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RELAQ04206 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RELAQ04206 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RELAQ04206 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RELAQ04206 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RELAQ04206 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RELAQ04206 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RELAQ04206 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RELAQ04206 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RELAQ04206 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RELAQ04206 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RELAQ04206 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RELAQ04206 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RELAQ04206 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RELAQ04206 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RELAQ04206 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RELAQ04206 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RELAQ04206 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RELAQ04206 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RELAQ04206 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RELAQ04206 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RELAQ04206 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RELAQ04206 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RELAQ04206 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RELAQ04206 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RELAQ04206 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RELAQ04206 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RELAQ04206 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RELAQ04206 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms