Protein–RNA interactions for Protein: Q03403

TFF2, Trefoil factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF2Q03403 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TFF2Q03403 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TFF2Q03403 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TFF2Q03403 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TFF2Q03403 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TFF2Q03403 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TFF2Q03403 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TFF2Q03403 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TFF2Q03403 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TFF2Q03403 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TFF2Q03403 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TFF2Q03403 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TFF2Q03403 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TFF2Q03403 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TFF2Q03403 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TFF2Q03403 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TFF2Q03403 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TFF2Q03403 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TFF2Q03403 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TFF2Q03403 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TFF2Q03403 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TFF2Q03403 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TFF2Q03403 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TFF2Q03403 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TFF2Q03403 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TFF2Q03403 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TFF2Q03403 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TFF2Q03403 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TFF2Q03403 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TFF2Q03403 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TFF2Q03403 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TFF2Q03403 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TFF2Q03403 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TFF2Q03403 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TFF2Q03403 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TFF2Q03403 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TFF2Q03403 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TFF2Q03403 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TFF2Q03403 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TFF2Q03403 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TFF2Q03403 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TFF2Q03403 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TFF2Q03403 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TFF2Q03403 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TFF2Q03403 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TFF2Q03403 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TFF2Q03403 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TFF2Q03403 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TFF2Q03403 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TFF2Q03403 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TFF2Q03403 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TFF2Q03403 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TFF2Q03403 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TFF2Q03403 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TFF2Q03403 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TFF2Q03403 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TFF2Q03403 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TFF2Q03403 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TFF2Q03403 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TFF2Q03403 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TFF2Q03403 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TFF2Q03403 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TFF2Q03403 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TFF2Q03403 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TFF2Q03403 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TFF2Q03403 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TFF2Q03403 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TFF2Q03403 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TFF2Q03403 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TFF2Q03403 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TFF2Q03403 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TFF2Q03403 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TFF2Q03403 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TFF2Q03403 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TFF2Q03403 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TFF2Q03403 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TFF2Q03403 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TFF2Q03403 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TFF2Q03403 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TFF2Q03403 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TFF2Q03403 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TFF2Q03403 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TFF2Q03403 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TFF2Q03403 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TFF2Q03403 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TFF2Q03403 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TFF2Q03403 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TFF2Q03403 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TFF2Q03403 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TFF2Q03403 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TFF2Q03403 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TFF2Q03403 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TFF2Q03403 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TFF2Q03403 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TFF2Q03403 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TFF2Q03403 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TFF2Q03403 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TFF2Q03403 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TFF2Q03403 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TFF2Q03403 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms