Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CYP4A11Q02928 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CYP4A11Q02928 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CYP4A11Q02928 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYP4A11Q02928 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CYP4A11Q02928 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CYP4A11Q02928 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CYP4A11Q02928 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CYP4A11Q02928 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CYP4A11Q02928 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CYP4A11Q02928 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CYP4A11Q02928 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CYP4A11Q02928 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYP4A11Q02928 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYP4A11Q02928 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CYP4A11Q02928 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CYP4A11Q02928 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CYP4A11Q02928 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CYP4A11Q02928 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CYP4A11Q02928 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP4A11Q02928 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP4A11Q02928 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP4A11Q02928 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CYP4A11Q02928 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CYP4A11Q02928 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CYP4A11Q02928 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CYP4A11Q02928 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CYP4A11Q02928 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CYP4A11Q02928 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CYP4A11Q02928 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CYP4A11Q02928 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CYP4A11Q02928 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CYP4A11Q02928 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CYP4A11Q02928 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CYP4A11Q02928 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CYP4A11Q02928 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CYP4A11Q02928 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CYP4A11Q02928 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CYP4A11Q02928 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CYP4A11Q02928 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CYP4A11Q02928 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP4A11Q02928 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP4A11Q02928 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP4A11Q02928 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP4A11Q02928 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP4A11Q02928 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP4A11Q02928 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP4A11Q02928 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP4A11Q02928 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP4A11Q02928 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP4A11Q02928 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP4A11Q02928 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP4A11Q02928 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP4A11Q02928 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP4A11Q02928 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CYP4A11Q02928 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CYP4A11Q02928 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CYP4A11Q02928 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CYP4A11Q02928 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CYP4A11Q02928 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CYP4A11Q02928 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CYP4A11Q02928 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CYP4A11Q02928 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CYP4A11Q02928 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CYP4A11Q02928 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CYP4A11Q02928 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CYP4A11Q02928 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CYP4A11Q02928 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CYP4A11Q02928 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CYP4A11Q02928 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CYP4A11Q02928 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CYP4A11Q02928 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CYP4A11Q02928 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYP4A11Q02928 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYP4A11Q02928 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CYP4A11Q02928 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CYP4A11Q02928 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYP4A11Q02928 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYP4A11Q02928 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CYP4A11Q02928 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CYP4A11Q02928 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CYP4A11Q02928 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CYP4A11Q02928 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CYP4A11Q02928 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CYP4A11Q02928 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CYP4A11Q02928 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CYP4A11Q02928 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CYP4A11Q02928 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CYP4A11Q02928 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CYP4A11Q02928 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CYP4A11Q02928 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CYP4A11Q02928 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CYP4A11Q02928 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CYP4A11Q02928 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CYP4A11Q02928 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CYP4A11Q02928 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CYP4A11Q02928 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CYP4A11Q02928 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CYP4A11Q02928 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CYP4A11Q02928 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms