Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC6A3Q01959 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC6A3Q01959 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC6A3Q01959 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC6A3Q01959 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC6A3Q01959 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC6A3Q01959 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC6A3Q01959 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC6A3Q01959 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC6A3Q01959 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC6A3Q01959 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC6A3Q01959 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC6A3Q01959 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC6A3Q01959 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC6A3Q01959 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC6A3Q01959 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC6A3Q01959 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC6A3Q01959 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC6A3Q01959 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC6A3Q01959 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC6A3Q01959 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC6A3Q01959 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC6A3Q01959 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC6A3Q01959 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC6A3Q01959 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC6A3Q01959 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC6A3Q01959 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC6A3Q01959 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC6A3Q01959 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC6A3Q01959 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC6A3Q01959 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC6A3Q01959 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC6A3Q01959 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC6A3Q01959 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC6A3Q01959 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC6A3Q01959 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC6A3Q01959 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC6A3Q01959 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC6A3Q01959 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC6A3Q01959 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC6A3Q01959 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC6A3Q01959 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC6A3Q01959 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC6A3Q01959 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC6A3Q01959 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC6A3Q01959 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC6A3Q01959 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC6A3Q01959 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC6A3Q01959 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC6A3Q01959 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC6A3Q01959 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC6A3Q01959 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC6A3Q01959 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC6A3Q01959 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC6A3Q01959 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC6A3Q01959 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC6A3Q01959 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC6A3Q01959 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC6A3Q01959 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC6A3Q01959 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC6A3Q01959 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC6A3Q01959 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC6A3Q01959 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC6A3Q01959 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC6A3Q01959 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC6A3Q01959 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC6A3Q01959 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC6A3Q01959 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC6A3Q01959 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC6A3Q01959 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC6A3Q01959 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC6A3Q01959 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC6A3Q01959 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC6A3Q01959 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC6A3Q01959 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC6A3Q01959 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC6A3Q01959 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC6A3Q01959 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC6A3Q01959 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC6A3Q01959 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC6A3Q01959 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC6A3Q01959 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC6A3Q01959 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC6A3Q01959 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC6A3Q01959 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC6A3Q01959 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC6A3Q01959 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC6A3Q01959 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SLC6A3Q01959 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC6A3Q01959 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC6A3Q01959 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC6A3Q01959 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC6A3Q01959 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC6A3Q01959 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC6A3Q01959 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC6A3Q01959 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC6A3Q01959 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC6A3Q01959 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC6A3Q01959 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC6A3Q01959 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms