Protein–RNA interactions for Protein: Q01415

GALK2, N-acetylgalactosamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALK2Q01415 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GALK2Q01415 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GALK2Q01415 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GALK2Q01415 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GALK2Q01415 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GALK2Q01415 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GALK2Q01415 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GALK2Q01415 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GALK2Q01415 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GALK2Q01415 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GALK2Q01415 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GALK2Q01415 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GALK2Q01415 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GALK2Q01415 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GALK2Q01415 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GALK2Q01415 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GALK2Q01415 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GALK2Q01415 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GALK2Q01415 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GALK2Q01415 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GALK2Q01415 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GALK2Q01415 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GALK2Q01415 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GALK2Q01415 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GALK2Q01415 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GALK2Q01415 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GALK2Q01415 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GALK2Q01415 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GALK2Q01415 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GALK2Q01415 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GALK2Q01415 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GALK2Q01415 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GALK2Q01415 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GALK2Q01415 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GALK2Q01415 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GALK2Q01415 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GALK2Q01415 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GALK2Q01415 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GALK2Q01415 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GALK2Q01415 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GALK2Q01415 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GALK2Q01415 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GALK2Q01415 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GALK2Q01415 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GALK2Q01415 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GALK2Q01415 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GALK2Q01415 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GALK2Q01415 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GALK2Q01415 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GALK2Q01415 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GALK2Q01415 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GALK2Q01415 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GALK2Q01415 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GALK2Q01415 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GALK2Q01415 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GALK2Q01415 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GALK2Q01415 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GALK2Q01415 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GALK2Q01415 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GALK2Q01415 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GALK2Q01415 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GALK2Q01415 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GALK2Q01415 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GALK2Q01415 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GALK2Q01415 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GALK2Q01415 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GALK2Q01415 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GALK2Q01415 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GALK2Q01415 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GALK2Q01415 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GALK2Q01415 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GALK2Q01415 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GALK2Q01415 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GALK2Q01415 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GALK2Q01415 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GALK2Q01415 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GALK2Q01415 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GALK2Q01415 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GALK2Q01415 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GALK2Q01415 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GALK2Q01415 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GALK2Q01415 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GALK2Q01415 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GALK2Q01415 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GALK2Q01415 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GALK2Q01415 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GALK2Q01415 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GALK2Q01415 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GALK2Q01415 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GALK2Q01415 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GALK2Q01415 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GALK2Q01415 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GALK2Q01415 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GALK2Q01415 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GALK2Q01415 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GALK2Q01415 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GALK2Q01415 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GALK2Q01415 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GALK2Q01415 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GALK2Q01415 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms