Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA1BQ00975 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA1BQ00975 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA1BQ00975 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA1BQ00975 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA1BQ00975 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA1BQ00975 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA1BQ00975 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA1BQ00975 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA1BQ00975 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA1BQ00975 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA1BQ00975 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA1BQ00975 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA1BQ00975 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA1BQ00975 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA1BQ00975 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA1BQ00975 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA1BQ00975 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA1BQ00975 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA1BQ00975 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA1BQ00975 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA1BQ00975 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA1BQ00975 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA1BQ00975 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA1BQ00975 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA1BQ00975 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA1BQ00975 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA1BQ00975 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA1BQ00975 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA1BQ00975 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA1BQ00975 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA1BQ00975 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA1BQ00975 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA1BQ00975 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CACNA1BQ00975 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CACNA1BQ00975 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CACNA1BQ00975 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA1BQ00975 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA1BQ00975 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA1BQ00975 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA1BQ00975 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA1BQ00975 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA1BQ00975 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA1BQ00975 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA1BQ00975 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA1BQ00975 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA1BQ00975 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA1BQ00975 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA1BQ00975 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA1BQ00975 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA1BQ00975 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA1BQ00975 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA1BQ00975 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA1BQ00975 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA1BQ00975 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA1BQ00975 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA1BQ00975 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA1BQ00975 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA1BQ00975 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA1BQ00975 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNA1BQ00975 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNA1BQ00975 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNA1BQ00975 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNA1BQ00975 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA1BQ00975 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA1BQ00975 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA1BQ00975 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA1BQ00975 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA1BQ00975 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA1BQ00975 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA1BQ00975 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA1BQ00975 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA1BQ00975 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA1BQ00975 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA1BQ00975 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA1BQ00975 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA1BQ00975 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA1BQ00975 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CACNA1BQ00975 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA1BQ00975 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA1BQ00975 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA1BQ00975 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA1BQ00975 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA1BQ00975 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA1BQ00975 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA1BQ00975 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA1BQ00975 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA1BQ00975 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA1BQ00975 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA1BQ00975 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA1BQ00975 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1BQ00975 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1BQ00975 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1BQ00975 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1BQ00975 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1BQ00975 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1BQ00975 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA1BQ00975 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA1BQ00975 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA1BQ00975 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms