Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFKB2Q00653 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFKB2Q00653 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKB2Q00653 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKB2Q00653 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKB2Q00653 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKB2Q00653 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKB2Q00653 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKB2Q00653 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFKB2Q00653 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFKB2Q00653 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFKB2Q00653 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFKB2Q00653 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFKB2Q00653 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFKB2Q00653 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFKB2Q00653 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFKB2Q00653 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFKB2Q00653 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFKB2Q00653 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFKB2Q00653 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFKB2Q00653 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFKB2Q00653 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFKB2Q00653 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFKB2Q00653 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFKB2Q00653 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFKB2Q00653 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFKB2Q00653 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NFKB2Q00653 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFKB2Q00653 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFKB2Q00653 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFKB2Q00653 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NFKB2Q00653 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFKB2Q00653 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFKB2Q00653 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFKB2Q00653 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFKB2Q00653 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFKB2Q00653 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFKB2Q00653 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFKB2Q00653 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFKB2Q00653 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFKB2Q00653 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFKB2Q00653 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFKB2Q00653 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFKB2Q00653 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFKB2Q00653 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFKB2Q00653 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFKB2Q00653 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFKB2Q00653 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFKB2Q00653 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFKB2Q00653 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFKB2Q00653 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFKB2Q00653 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFKB2Q00653 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFKB2Q00653 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFKB2Q00653 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFKB2Q00653 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFKB2Q00653 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFKB2Q00653 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFKB2Q00653 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFKB2Q00653 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFKB2Q00653 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFKB2Q00653 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFKB2Q00653 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFKB2Q00653 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFKB2Q00653 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFKB2Q00653 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFKB2Q00653 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFKB2Q00653 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFKB2Q00653 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFKB2Q00653 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFKB2Q00653 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFKB2Q00653 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFKB2Q00653 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFKB2Q00653 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFKB2Q00653 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFKB2Q00653 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NFKB2Q00653 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFKB2Q00653 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NFKB2Q00653 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NFKB2Q00653 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFKB2Q00653 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFKB2Q00653 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFKB2Q00653 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFKB2Q00653 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFKB2Q00653 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFKB2Q00653 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFKB2Q00653 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFKB2Q00653 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFKB2Q00653 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFKB2Q00653 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NFKB2Q00653 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFKB2Q00653 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFKB2Q00653 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFKB2Q00653 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFKB2Q00653 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NFKB2Q00653 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKB2Q00653 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKB2Q00653 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKB2Q00653 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKB2Q00653 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms