Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
IRX3P78415 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
IRX3P78415 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
IRX3P78415 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
IRX3P78415 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
IRX3P78415 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
IRX3P78415 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
IRX3P78415 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
IRX3P78415 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
IRX3P78415 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
IRX3P78415 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
IRX3P78415 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
IRX3P78415 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
IRX3P78415 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
IRX3P78415 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
IRX3P78415 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
IRX3P78415 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
IRX3P78415 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
IRX3P78415 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
IRX3P78415 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
IRX3P78415 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
IRX3P78415 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IRX3P78415 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IRX3P78415 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IRX3P78415 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IRX3P78415 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
IRX3P78415 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
IRX3P78415 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
IRX3P78415 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
IRX3P78415 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
IRX3P78415 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
IRX3P78415 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
IRX3P78415 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
IRX3P78415 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
IRX3P78415 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
IRX3P78415 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
IRX3P78415 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
IRX3P78415 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
IRX3P78415 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
IRX3P78415 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
IRX3P78415 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
IRX3P78415 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
IRX3P78415 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
IRX3P78415 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
IRX3P78415 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
IRX3P78415 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
IRX3P78415 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
IRX3P78415 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
IRX3P78415 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
IRX3P78415 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
IRX3P78415 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
IRX3P78415 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
IRX3P78415 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
IRX3P78415 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
IRX3P78415 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
IRX3P78415 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
IRX3P78415 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
IRX3P78415 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
IRX3P78415 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
IRX3P78415 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
IRX3P78415 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IRX3P78415 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
IRX3P78415 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IRX3P78415 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
IRX3P78415 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
IRX3P78415 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
IRX3P78415 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
IRX3P78415 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
IRX3P78415 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
IRX3P78415 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
IRX3P78415 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
IRX3P78415 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
IRX3P78415 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
IRX3P78415 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
IRX3P78415 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
IRX3P78415 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
IRX3P78415 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
IRX3P78415 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
IRX3P78415 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
IRX3P78415 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
IRX3P78415 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
IRX3P78415 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
IRX3P78415 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
IRX3P78415 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
IRX3P78415 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
IRX3P78415 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IRX3P78415 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IRX3P78415 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
IRX3P78415 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
IRX3P78415 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
IRX3P78415 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
IRX3P78415 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
IRX3P78415 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
IRX3P78415 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
IRX3P78415 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
IRX3P78415 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
IRX3P78415 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
IRX3P78415 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
IRX3P78415 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
IRX3P78415 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms