Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SH3BP2P78314 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SH3BP2P78314 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SH3BP2P78314 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3BP2P78314 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3BP2P78314 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3BP2P78314 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3BP2P78314 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2P78314 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2P78314 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2P78314 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2P78314 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2P78314 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2P78314 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH3BP2P78314 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH3BP2P78314 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH3BP2P78314 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH3BP2P78314 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH3BP2P78314 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH3BP2P78314 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3BP2P78314 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3BP2P78314 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3BP2P78314 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3BP2P78314 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3BP2P78314 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3BP2P78314 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3BP2P78314 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3BP2P78314 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3BP2P78314 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3BP2P78314 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3BP2P78314 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3BP2P78314 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3BP2P78314 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3BP2P78314 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3BP2P78314 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH3BP2P78314 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH3BP2P78314 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3BP2P78314 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3BP2P78314 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3BP2P78314 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3BP2P78314 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3BP2P78314 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3BP2P78314 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3BP2P78314 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3BP2P78314 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3BP2P78314 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3BP2P78314 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3BP2P78314 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3BP2P78314 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3BP2P78314 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3BP2P78314 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3BP2P78314 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3BP2P78314 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3BP2P78314 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3BP2P78314 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3BP2P78314 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3BP2P78314 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3BP2P78314 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3BP2P78314 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3BP2P78314 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3BP2P78314 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3BP2P78314 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3BP2P78314 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3BP2P78314 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3BP2P78314 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3BP2P78314 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3BP2P78314 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3BP2P78314 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3BP2P78314 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3BP2P78314 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3BP2P78314 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3BP2P78314 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3BP2P78314 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3BP2P78314 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3BP2P78314 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3BP2P78314 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3BP2P78314 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3BP2P78314 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH3BP2P78314 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SH3BP2P78314 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SH3BP2P78314 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SH3BP2P78314 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH3BP2P78314 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2P78314 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SH3BP2P78314 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH3BP2P78314 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SH3BP2P78314 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH3BP2P78314 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH3BP2P78314 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH3BP2P78314 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3BP2P78314 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3BP2P78314 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3BP2P78314 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3BP2P78314 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3BP2P78314 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3BP2P78314 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3BP2P78314 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3BP2P78314 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3BP2P78314 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH3BP2P78314 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
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