Protein–RNA interactions for Protein: P62333

PSMC6, 26S proteasome regulatory subunit 10B, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC6P62333 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSMC6P62333 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSMC6P62333 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSMC6P62333 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSMC6P62333 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSMC6P62333 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSMC6P62333 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSMC6P62333 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSMC6P62333 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSMC6P62333 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSMC6P62333 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSMC6P62333 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSMC6P62333 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PSMC6P62333 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PSMC6P62333 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PSMC6P62333 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PSMC6P62333 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSMC6P62333 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSMC6P62333 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSMC6P62333 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSMC6P62333 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSMC6P62333 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSMC6P62333 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSMC6P62333 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSMC6P62333 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSMC6P62333 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSMC6P62333 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSMC6P62333 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PSMC6P62333 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PSMC6P62333 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PSMC6P62333 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PSMC6P62333 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PSMC6P62333 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PSMC6P62333 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PSMC6P62333 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PSMC6P62333 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSMC6P62333 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSMC6P62333 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSMC6P62333 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSMC6P62333 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSMC6P62333 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PSMC6P62333 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PSMC6P62333 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PSMC6P62333 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PSMC6P62333 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSMC6P62333 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSMC6P62333 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSMC6P62333 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSMC6P62333 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PSMC6P62333 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSMC6P62333 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSMC6P62333 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSMC6P62333 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSMC6P62333 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSMC6P62333 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSMC6P62333 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSMC6P62333 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSMC6P62333 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PSMC6P62333 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PSMC6P62333 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PSMC6P62333 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PSMC6P62333 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PSMC6P62333 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PSMC6P62333 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PSMC6P62333 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PSMC6P62333 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PSMC6P62333 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PSMC6P62333 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PSMC6P62333 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSMC6P62333 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PSMC6P62333 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSMC6P62333 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSMC6P62333 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PSMC6P62333 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PSMC6P62333 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PSMC6P62333 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PSMC6P62333 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PSMC6P62333 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PSMC6P62333 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PSMC6P62333 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PSMC6P62333 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PSMC6P62333 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PSMC6P62333 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSMC6P62333 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSMC6P62333 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSMC6P62333 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSMC6P62333 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PSMC6P62333 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSMC6P62333 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSMC6P62333 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSMC6P62333 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSMC6P62333 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSMC6P62333 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PSMC6P62333 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PSMC6P62333 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSMC6P62333 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSMC6P62333 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PSMC6P62333 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PSMC6P62333 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
PSMC6P62333 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms