Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHMP4BP1P59074 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHMP4BP1P59074 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHMP4BP1P59074 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHMP4BP1P59074 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHMP4BP1P59074 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHMP4BP1P59074 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHMP4BP1P59074 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHMP4BP1P59074 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHMP4BP1P59074 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHMP4BP1P59074 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHMP4BP1P59074 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHMP4BP1P59074 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CHMP4BP1P59074 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CHMP4BP1P59074 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHMP4BP1P59074 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHMP4BP1P59074 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHMP4BP1P59074 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHMP4BP1P59074 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHMP4BP1P59074 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHMP4BP1P59074 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHMP4BP1P59074 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHMP4BP1P59074 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHMP4BP1P59074 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHMP4BP1P59074 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHMP4BP1P59074 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHMP4BP1P59074 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CHMP4BP1P59074 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHMP4BP1P59074 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHMP4BP1P59074 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHMP4BP1P59074 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHMP4BP1P59074 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CHMP4BP1P59074 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHMP4BP1P59074 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHMP4BP1P59074 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHMP4BP1P59074 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHMP4BP1P59074 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHMP4BP1P59074 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHMP4BP1P59074 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHMP4BP1P59074 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHMP4BP1P59074 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHMP4BP1P59074 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHMP4BP1P59074 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHMP4BP1P59074 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHMP4BP1P59074 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHMP4BP1P59074 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHMP4BP1P59074 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHMP4BP1P59074 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHMP4BP1P59074 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHMP4BP1P59074 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHMP4BP1P59074 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHMP4BP1P59074 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHMP4BP1P59074 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHMP4BP1P59074 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHMP4BP1P59074 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHMP4BP1P59074 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHMP4BP1P59074 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHMP4BP1P59074 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHMP4BP1P59074 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHMP4BP1P59074 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHMP4BP1P59074 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHMP4BP1P59074 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHMP4BP1P59074 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CHMP4BP1P59074 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CHMP4BP1P59074 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMP4BP1P59074 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMP4BP1P59074 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMP4BP1P59074 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHMP4BP1P59074 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHMP4BP1P59074 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHMP4BP1P59074 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHMP4BP1P59074 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHMP4BP1P59074 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CHMP4BP1P59074 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHMP4BP1P59074 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHMP4BP1P59074 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHMP4BP1P59074 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHMP4BP1P59074 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHMP4BP1P59074 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHMP4BP1P59074 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHMP4BP1P59074 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHMP4BP1P59074 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHMP4BP1P59074 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CHMP4BP1P59074 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHMP4BP1P59074 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHMP4BP1P59074 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHMP4BP1P59074 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHMP4BP1P59074 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHMP4BP1P59074 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHMP4BP1P59074 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHMP4BP1P59074 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHMP4BP1P59074 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CHMP4BP1P59074 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHMP4BP1P59074 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHMP4BP1P59074 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHMP4BP1P59074 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CHMP4BP1P59074 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHMP4BP1P59074 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHMP4BP1P59074 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHMP4BP1P59074 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms