Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAD23BP54727 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAD23BP54727 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RAD23BP54727 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
RAD23BP54727 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RAD23BP54727 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAD23BP54727 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RAD23BP54727 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAD23BP54727 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAD23BP54727 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAD23BP54727 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAD23BP54727 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAD23BP54727 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAD23BP54727 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAD23BP54727 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAD23BP54727 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RAD23BP54727 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAD23BP54727 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAD23BP54727 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAD23BP54727 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAD23BP54727 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAD23BP54727 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAD23BP54727 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAD23BP54727 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAD23BP54727 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAD23BP54727 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAD23BP54727 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAD23BP54727 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAD23BP54727 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAD23BP54727 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAD23BP54727 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAD23BP54727 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAD23BP54727 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAD23BP54727 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAD23BP54727 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAD23BP54727 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAD23BP54727 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAD23BP54727 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RAD23BP54727 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAD23BP54727 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAD23BP54727 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAD23BP54727 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RAD23BP54727 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAD23BP54727 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAD23BP54727 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAD23BP54727 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAD23BP54727 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAD23BP54727 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAD23BP54727 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAD23BP54727 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAD23BP54727 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RAD23BP54727 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAD23BP54727 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAD23BP54727 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAD23BP54727 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAD23BP54727 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAD23BP54727 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD23BP54727 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD23BP54727 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD23BP54727 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAD23BP54727 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAD23BP54727 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAD23BP54727 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD23BP54727 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD23BP54727 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD23BP54727 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD23BP54727 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD23BP54727 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD23BP54727 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD23BP54727 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAD23BP54727 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAD23BP54727 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAD23BP54727 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RAD23BP54727 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RAD23BP54727 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RAD23BP54727 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAD23BP54727 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAD23BP54727 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAD23BP54727 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAD23BP54727 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAD23BP54727 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAD23BP54727 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAD23BP54727 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RAD23BP54727 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAD23BP54727 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAD23BP54727 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAD23BP54727 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAD23BP54727 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAD23BP54727 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAD23BP54727 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAD23BP54727 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAD23BP54727 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RAD23BP54727 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAD23BP54727 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAD23BP54727 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAD23BP54727 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAD23BP54727 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAD23BP54727 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RAD23BP54727 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RAD23BP54727 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms