Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
HIRAP54198 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HIRAP54198 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HIRAP54198 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
HIRAP54198 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
HIRAP54198 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
HIRAP54198 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
HIRAP54198 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
HIRAP54198 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
HIRAP54198 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
HIRAP54198 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
HIRAP54198 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
HIRAP54198 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
HIRAP54198 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
HIRAP54198 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
HIRAP54198 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
HIRAP54198 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
HIRAP54198 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
HIRAP54198 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
HIRAP54198 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
HIRAP54198 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
HIRAP54198 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
HIRAP54198 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
HIRAP54198 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
HIRAP54198 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
HIRAP54198 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
HIRAP54198 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
HIRAP54198 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
HIRAP54198 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
HIRAP54198 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
HIRAP54198 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
HIRAP54198 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
HIRAP54198 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
HIRAP54198 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
HIRAP54198 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
HIRAP54198 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
HIRAP54198 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
HIRAP54198 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
HIRAP54198 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
HIRAP54198 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
HIRAP54198 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
HIRAP54198 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
HIRAP54198 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
HIRAP54198 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
HIRAP54198 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
HIRAP54198 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
HIRAP54198 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
HIRAP54198 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
HIRAP54198 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
HIRAP54198 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
HIRAP54198 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
HIRAP54198 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
HIRAP54198 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
HIRAP54198 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
HIRAP54198 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HIRAP54198 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HIRAP54198 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
HIRAP54198 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HIRAP54198 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HIRAP54198 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
HIRAP54198 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
HIRAP54198 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
HIRAP54198 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
HIRAP54198 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HIRAP54198 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
HIRAP54198 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
HIRAP54198 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HIRAP54198 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HIRAP54198 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
HIRAP54198 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
HIRAP54198 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
HIRAP54198 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
HIRAP54198 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
HIRAP54198 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HIRAP54198 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HIRAP54198 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HIRAP54198 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HIRAP54198 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
HIRAP54198 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
HIRAP54198 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
HIRAP54198 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
HIRAP54198 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
HIRAP54198 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
HIRAP54198 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
HIRAP54198 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
HIRAP54198 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
HIRAP54198 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
HIRAP54198 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
HIRAP54198 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
HIRAP54198 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
HIRAP54198 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
HIRAP54198 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
HIRAP54198 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
HIRAP54198 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
HIRAP54198 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
HIRAP54198 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
HIRAP54198 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
HIRAP54198 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
HIRAP54198 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
HIRAP54198 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms