Protein–RNA interactions for Protein: P52434

POLR2H, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2HP52434 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2HP52434 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2HP52434 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2HP52434 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2HP52434 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2HP52434 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2HP52434 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2HP52434 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2HP52434 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2HP52434 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2HP52434 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2HP52434 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2HP52434 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2HP52434 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2HP52434 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2HP52434 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2HP52434 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2HP52434 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2HP52434 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2HP52434 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2HP52434 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2HP52434 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2HP52434 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2HP52434 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2HP52434 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2HP52434 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2HP52434 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2HP52434 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2HP52434 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2HP52434 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2HP52434 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2HP52434 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2HP52434 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2HP52434 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2HP52434 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2HP52434 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2HP52434 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2HP52434 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2HP52434 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2HP52434 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2HP52434 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2HP52434 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2HP52434 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2HP52434 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2HP52434 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2HP52434 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2HP52434 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2HP52434 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2HP52434 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2HP52434 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2HP52434 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2HP52434 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2HP52434 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2HP52434 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2HP52434 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2HP52434 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2HP52434 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2HP52434 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2HP52434 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2HP52434 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2HP52434 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2HP52434 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2HP52434 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2HP52434 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2HP52434 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2HP52434 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2HP52434 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2HP52434 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2HP52434 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2HP52434 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2HP52434 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2HP52434 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2HP52434 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2HP52434 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2HP52434 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2HP52434 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2HP52434 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR2HP52434 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR2HP52434 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2HP52434 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2HP52434 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2HP52434 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2HP52434 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2HP52434 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2HP52434 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2HP52434 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2HP52434 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2HP52434 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2HP52434 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2HP52434 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2HP52434 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2HP52434 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2HP52434 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2HP52434 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2HP52434 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2HP52434 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2HP52434 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2HP52434 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2HP52434 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2HP52434 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms