Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KPNA1P52294 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KPNA1P52294 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KPNA1P52294 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KPNA1P52294 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KPNA1P52294 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KPNA1P52294 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KPNA1P52294 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KPNA1P52294 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KPNA1P52294 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KPNA1P52294 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KPNA1P52294 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KPNA1P52294 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KPNA1P52294 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
KPNA1P52294 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KPNA1P52294 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KPNA1P52294 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KPNA1P52294 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KPNA1P52294 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KPNA1P52294 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KPNA1P52294 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms