Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FNTBP49356 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FNTBP49356 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FNTBP49356 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FNTBP49356 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FNTBP49356 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FNTBP49356 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FNTBP49356 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FNTBP49356 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
FNTBP49356 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FNTBP49356 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FNTBP49356 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FNTBP49356 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FNTBP49356 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FNTBP49356 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FNTBP49356 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FNTBP49356 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FNTBP49356 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FNTBP49356 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FNTBP49356 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FNTBP49356 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FNTBP49356 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FNTBP49356 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FNTBP49356 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
FNTBP49356 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FNTBP49356 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FNTBP49356 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FNTBP49356 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FNTBP49356 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FNTBP49356 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FNTBP49356 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FNTBP49356 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FNTBP49356 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FNTBP49356 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FNTBP49356 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
FNTBP49356 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FNTBP49356 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FNTBP49356 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FNTBP49356 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FNTBP49356 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FNTBP49356 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
FNTBP49356 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FNTBP49356 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FNTBP49356 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FNTBP49356 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FNTBP49356 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FNTBP49356 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FNTBP49356 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FNTBP49356 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FNTBP49356 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FNTBP49356 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FNTBP49356 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FNTBP49356 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FNTBP49356 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
FNTBP49356 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FNTBP49356 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
FNTBP49356 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FNTBP49356 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FNTBP49356 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FNTBP49356 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FNTBP49356 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FNTBP49356 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FNTBP49356 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FNTBP49356 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FNTBP49356 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FNTBP49356 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FNTBP49356 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FNTBP49356 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FNTBP49356 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
FNTBP49356 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FNTBP49356 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FNTBP49356 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FNTBP49356 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FNTBP49356 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FNTBP49356 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FNTBP49356 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FNTBP49356 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FNTBP49356 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FNTBP49356 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FNTBP49356 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FNTBP49356 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FNTBP49356 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FNTBP49356 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FNTBP49356 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FNTBP49356 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FNTBP49356 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FNTBP49356 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FNTBP49356 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FNTBP49356 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FNTBP49356 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
FNTBP49356 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FNTBP49356 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FNTBP49356 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FNTBP49356 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FNTBP49356 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
FNTBP49356 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FNTBP49356 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FNTBP49356 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FNTBP49356 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FNTBP49356 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms