Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RXRGP48443 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RXRGP48443 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RXRGP48443 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RXRGP48443 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RXRGP48443 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RXRGP48443 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RXRGP48443 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RXRGP48443 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RXRGP48443 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RXRGP48443 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RXRGP48443 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RXRGP48443 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RXRGP48443 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RXRGP48443 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RXRGP48443 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RXRGP48443 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RXRGP48443 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RXRGP48443 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RXRGP48443 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RXRGP48443 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RXRGP48443 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RXRGP48443 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RXRGP48443 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RXRGP48443 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RXRGP48443 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RXRGP48443 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RXRGP48443 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RXRGP48443 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RXRGP48443 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RXRGP48443 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RXRGP48443 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RXRGP48443 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RXRGP48443 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RXRGP48443 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RXRGP48443 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RXRGP48443 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RXRGP48443 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RXRGP48443 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RXRGP48443 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RXRGP48443 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RXRGP48443 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RXRGP48443 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RXRGP48443 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RXRGP48443 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RXRGP48443 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RXRGP48443 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RXRGP48443 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RXRGP48443 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RXRGP48443 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RXRGP48443 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RXRGP48443 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RXRGP48443 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RXRGP48443 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RXRGP48443 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RXRGP48443 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RXRGP48443 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RXRGP48443 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RXRGP48443 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RXRGP48443 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RXRGP48443 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RXRGP48443 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RXRGP48443 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RXRGP48443 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RXRGP48443 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RXRGP48443 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RXRGP48443 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RXRGP48443 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RXRGP48443 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RXRGP48443 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RXRGP48443 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RXRGP48443 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RXRGP48443 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RXRGP48443 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RXRGP48443 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RXRGP48443 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RXRGP48443 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RXRGP48443 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RXRGP48443 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RXRGP48443 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RXRGP48443 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RXRGP48443 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RXRGP48443 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RXRGP48443 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RXRGP48443 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RXRGP48443 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RXRGP48443 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RXRGP48443 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RXRGP48443 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RXRGP48443 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RXRGP48443 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RXRGP48443 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RXRGP48443 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RXRGP48443 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RXRGP48443 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RXRGP48443 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RXRGP48443 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RXRGP48443 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RXRGP48443 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RXRGP48443 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms