Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ABCG1P45844 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ABCG1P45844 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCG1P45844 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCG1P45844 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCG1P45844 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCG1P45844 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCG1P45844 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCG1P45844 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCG1P45844 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCG1P45844 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCG1P45844 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCG1P45844 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCG1P45844 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCG1P45844 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCG1P45844 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCG1P45844 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCG1P45844 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCG1P45844 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCG1P45844 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCG1P45844 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCG1P45844 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCG1P45844 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCG1P45844 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCG1P45844 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCG1P45844 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCG1P45844 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCG1P45844 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms