Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ABCG1P45844 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ABCG1P45844 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCG1P45844 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCG1P45844 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCG1P45844 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCG1P45844 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCG1P45844 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCG1P45844 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCG1P45844 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCG1P45844 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCG1P45844 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCG1P45844 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCG1P45844 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCG1P45844 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
ABCG1P45844 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ABCG1P45844 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCG1P45844 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCG1P45844 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCG1P45844 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCG1P45844 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCG1P45844 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCG1P45844 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCG1P45844 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCG1P45844 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCG1P45844 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCG1P45844 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCG1P45844 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCG1P45844 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCG1P45844 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms