Protein–RNA interactions for Protein: P43686

PSMC4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC4P43686 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PSMC4P43686 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PSMC4P43686 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
PSMC4P43686 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PSMC4P43686 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PSMC4P43686 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PSMC4P43686 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PSMC4P43686 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PSMC4P43686 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PSMC4P43686 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PSMC4P43686 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PSMC4P43686 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PSMC4P43686 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PSMC4P43686 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PSMC4P43686 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PSMC4P43686 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PSMC4P43686 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PSMC4P43686 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PSMC4P43686 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PSMC4P43686 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PSMC4P43686 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PSMC4P43686 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PSMC4P43686 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PSMC4P43686 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PSMC4P43686 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PSMC4P43686 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PSMC4P43686 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PSMC4P43686 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PSMC4P43686 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PSMC4P43686 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PSMC4P43686 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PSMC4P43686 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PSMC4P43686 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PSMC4P43686 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PSMC4P43686 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PSMC4P43686 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PSMC4P43686 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PSMC4P43686 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSMC4P43686 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PSMC4P43686 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSMC4P43686 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSMC4P43686 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSMC4P43686 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PSMC4P43686 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PSMC4P43686 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PSMC4P43686 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PSMC4P43686 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PSMC4P43686 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PSMC4P43686 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PSMC4P43686 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PSMC4P43686 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PSMC4P43686 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PSMC4P43686 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PSMC4P43686 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PSMC4P43686 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PSMC4P43686 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PSMC4P43686 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PSMC4P43686 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PSMC4P43686 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PSMC4P43686 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PSMC4P43686 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PSMC4P43686 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PSMC4P43686 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PSMC4P43686 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PSMC4P43686 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PSMC4P43686 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PSMC4P43686 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PSMC4P43686 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PSMC4P43686 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PSMC4P43686 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PSMC4P43686 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PSMC4P43686 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PSMC4P43686 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PSMC4P43686 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PSMC4P43686 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PSMC4P43686 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PSMC4P43686 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PSMC4P43686 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PSMC4P43686 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PSMC4P43686 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PSMC4P43686 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PSMC4P43686 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PSMC4P43686 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PSMC4P43686 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PSMC4P43686 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSMC4P43686 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSMC4P43686 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PSMC4P43686 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSMC4P43686 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSMC4P43686 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSMC4P43686 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSMC4P43686 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PSMC4P43686 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PSMC4P43686 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PSMC4P43686 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PSMC4P43686 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PSMC4P43686 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSMC4P43686 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PSMC4P43686 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PSMC4P43686 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms