Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRPHP41219 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRPHP41219 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRPHP41219 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRPHP41219 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRPHP41219 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRPHP41219 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRPHP41219 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PRPHP41219 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRPHP41219 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRPHP41219 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRPHP41219 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRPHP41219 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRPHP41219 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRPHP41219 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PRPHP41219 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRPHP41219 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRPHP41219 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRPHP41219 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRPHP41219 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRPHP41219 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRPHP41219 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PRPHP41219 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRPHP41219 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRPHP41219 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRPHP41219 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRPHP41219 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PRPHP41219 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRPHP41219 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRPHP41219 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PRPHP41219 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRPHP41219 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRPHP41219 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRPHP41219 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PRPHP41219 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRPHP41219 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PRPHP41219 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRPHP41219 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRPHP41219 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRPHP41219 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRPHP41219 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRPHP41219 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRPHP41219 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRPHP41219 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRPHP41219 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRPHP41219 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRPHP41219 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRPHP41219 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRPHP41219 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRPHP41219 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRPHP41219 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPHP41219 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPHP41219 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPHP41219 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPHP41219 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPHP41219 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPHP41219 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPHP41219 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPHP41219 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPHP41219 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPHP41219 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRPHP41219 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRPHP41219 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRPHP41219 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRPHP41219 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRPHP41219 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRPHP41219 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRPHP41219 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRPHP41219 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRPHP41219 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRPHP41219 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRPHP41219 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRPHP41219 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRPHP41219 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRPHP41219 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRPHP41219 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRPHP41219 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRPHP41219 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRPHP41219 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRPHP41219 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRPHP41219 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRPHP41219 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PRPHP41219 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRPHP41219 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRPHP41219 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRPHP41219 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRPHP41219 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRPHP41219 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRPHP41219 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRPHP41219 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRPHP41219 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRPHP41219 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRPHP41219 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRPHP41219 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRPHP41219 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRPHP41219 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRPHP41219 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRPHP41219 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRPHP41219 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRPHP41219 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms