Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MDH1P40925 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MDH1P40925 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MDH1P40925 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MDH1P40925 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MDH1P40925 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MDH1P40925 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MDH1P40925 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MDH1P40925 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MDH1P40925 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MDH1P40925 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MDH1P40925 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MDH1P40925 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MDH1P40925 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MDH1P40925 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MDH1P40925 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MDH1P40925 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MDH1P40925 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MDH1P40925 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MDH1P40925 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MDH1P40925 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MDH1P40925 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MDH1P40925 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MDH1P40925 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MDH1P40925 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MDH1P40925 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
MDH1P40925 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
MDH1P40925 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MDH1P40925 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MDH1P40925 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MDH1P40925 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MDH1P40925 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MDH1P40925 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MDH1P40925 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MDH1P40925 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MDH1P40925 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MDH1P40925 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MDH1P40925 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MDH1P40925 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MDH1P40925 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MDH1P40925 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MDH1P40925 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MDH1P40925 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MDH1P40925 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MDH1P40925 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MDH1P40925 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MDH1P40925 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MDH1P40925 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MDH1P40925 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MDH1P40925 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MDH1P40925 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MDH1P40925 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MDH1P40925 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MDH1P40925 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MDH1P40925 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MDH1P40925 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MDH1P40925 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MDH1P40925 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MDH1P40925 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MDH1P40925 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MDH1P40925 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MDH1P40925 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MDH1P40925 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MDH1P40925 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MDH1P40925 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MDH1P40925 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MDH1P40925 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MDH1P40925 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MDH1P40925 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MDH1P40925 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MDH1P40925 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MDH1P40925 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MDH1P40925 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MDH1P40925 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MDH1P40925 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MDH1P40925 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MDH1P40925 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MDH1P40925 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MDH1P40925 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MDH1P40925 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MDH1P40925 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MDH1P40925 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MDH1P40925 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MDH1P40925 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MDH1P40925 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MDH1P40925 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MDH1P40925 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MDH1P40925 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MDH1P40925 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MDH1P40925 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MDH1P40925 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MDH1P40925 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MDH1P40925 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MDH1P40925 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MDH1P40925 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MDH1P40925 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MDH1P40925 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MDH1P40925 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MDH1P40925 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MDH1P40925 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms