Protein–RNA interactions for Protein: P39543

SOP4, Protein SOP4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SOP4P39543 RSM7YJR113C 744 nt7.46□□□□□ -1.22
SOP4P39543 VBA3YCL069W 1377 nt7.46□□□□□ -1.22
SOP4P39543 THP3YPR045C 1413 nt7.45□□□□□ -1.22
SOP4P39543 YEL008WYEL008W 381 nt7.45□□□□□ -1.22
SOP4P39543 RRT6YGL146C 936 nt7.45□□□□□ -1.22
SOP4P39543 YER152CYER152C 1332 nt7.45□□□□□ -1.22
SOP4P39543 SDS24YBR214W 1584 nt7.45□□□□□ -1.22
SOP4P39543 DIP5YPL265W 1827 nt7.45□□□□□ -1.22
SOP4P39543 TDA4YJR116W 840 nt7.44□□□□□ -1.22
SOP4P39543 BEM1YBR200W 1656 nt7.44□□□□□ -1.22
SOP4P39543 KTR4YBR199W 1395 nt7.44□□□□□ -1.22
SOP4P39543 HXT9YJL219W 1704 nt7.44□□□□□ -1.22
SOP4P39543 TUB4YLR212C 1422 nt7.44□□□□□ -1.22
SOP4P39543 SGF73YGL066W 1974 nt7.43□□□□□ -1.22
SOP4P39543 FSH2YMR222C 672 nt7.43□□□□□ -1.22
SOP4P39543 MRP7YNL005C 1116 nt7.43□□□□□ -1.22
SOP4P39543 YEL023CYEL023C 2049 nt7.43□□□□□ -1.22
SOP4P39543 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.42□□□□□ -1.22
SOP4P39543 EHT1YBR177C 1356 nt7.42□□□□□ -1.22
SOP4P39543 FUN14YAL008W 597 nt7.41□□□□□ -1.22
SOP4P39543 ERG6YML008C 1152 nt7.41□□□□□ -1.22
SOP4P39543 GSF2YML048W 1212 nt7.41□□□□□ -1.22
SOP4P39543 ARO3YDR035W 1113 nt7.4□□□□□ -1.22
SOP4P39543 ATP10YLR393W 840 nt7.4□□□□□ -1.22
SOP4P39543 CDD1YLR245C 429 nt7.39□□□□□ -1.23
SOP4P39543 YIL177CYIL177C 5277 nt7.38□□□□□ -1.23
SOP4P39543 ALG7YBR243C 1347 nt7.38□□□□□ -1.23
SOP4P39543 ADH3YMR083W 1128 nt7.38□□□□□ -1.23
SOP4P39543 YFR020WYFR020W 699 nt7.37□□□□□ -1.23
SOP4P39543 RSC9YML127W 1746 nt7.37□□□□□ -1.23
SOP4P39543 PUS7YOR243C 2031 nt7.36□□□□□ -1.23
SOP4P39543 STF1YDL130W-A 261 nt7.36□□□□□ -1.23
SOP4P39543 PHB2YGR231C 933 nt7.36□□□□□ -1.23
SOP4P39543 RNA170RNA170 169 nt7.36□□□□□ -1.23
SOP4P39543 YMR253CYMR253C 1245 nt7.36□□□□□ -1.23
SOP4P39543 ELP6YMR312W 822 nt7.36□□□□□ -1.23
SOP4P39543 TPO1YLL028W 1761 nt7.36□□□□□ -1.23
SOP4P39543 TOP3YLR234W 1971 nt7.35□□□□□ -1.23
SOP4P39543 PMT1YDL095W 2454 nt7.35□□□□□ -1.23
SOP4P39543 MTC6YHR151C 1581 nt7.35□□□□□ -1.23
SOP4P39543 ENO1YGR254W 1314 nt7.34□□□□□ -1.23
SOP4P39543 ERR3YMR323W 1314 nt7.34□□□□□ -1.23
SOP4P39543 ERR1YOR393W 1314 nt7.34□□□□□ -1.23
SOP4P39543 ERR2YPL281C 1314 nt7.34□□□□□ -1.23
SOP4P39543 YLR460CYLR460C 1131 nt7.34□□□□□ -1.23
SOP4P39543 RCF1YML030W 480 nt7.34□□□□□ -1.23
SOP4P39543 WSC3YOL105C 1671 nt7.34□□□□□ -1.23
SOP4P39543 AVL9YLR114C 2295 nt7.34□□□□□ -1.24
SOP4P39543 CKB1YGL019W 837 nt7.33□□□□□ -1.24
SOP4P39543 YLR030WYLR030W 792 nt7.33□□□□□ -1.24
SOP4P39543 YJL045WYJL045W 1905 nt7.33□□□□□ -1.24
SOP4P39543 MOB1YIL106W 945 nt7.32□□□□□ -1.24
SOP4P39543 YGR137WYGR137W 375 nt7.31□□□□□ -1.24
SOP4P39543 MET22YOL064C 1074 nt7.31□□□□□ -1.24
SOP4P39543 STE4YOR212W 1272 nt7.31□□□□□ -1.24
SOP4P39543 OLA1YBR025C 1185 nt7.31□□□□□ -1.24
SOP4P39543 PDC5YLR134W 1692 nt7.31□□□□□ -1.24
SOP4P39543 GUT1YHL032C 2130 nt7.3□□□□□ -1.24
SOP4P39543 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.3□□□□□ -1.24
SOP4P39543 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.3□□□□□ -1.24
SOP4P39543 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.3□□□□□ -1.24
SOP4P39543 SNP1YIL061C 903 nt7.3□□□□□ -1.24
SOP4P39543 CHS7YHR142W 951 nt7.29□□□□□ -1.24
SOP4P39543 PEX28YHR150W 1740 nt7.29□□□□□ -1.24
SOP4P39543 GGC1YDL198C 903 nt7.28□□□□□ -1.24
SOP4P39543 SNA3YJL151C 402 nt7.28□□□□□ -1.24
SOP4P39543 TES1YJR019C 1050 nt7.28□□□□□ -1.24
SOP4P39543 CDA1YLR307W 906 nt7.27□□□□□ -1.25
SOP4P39543 SHC1YER096W 1539 nt7.27□□□□□ -1.25
SOP4P39543 IGD1YFR017C 588 nt7.26□□□□□ -1.25
SOP4P39543 RHO1YPR165W 630 nt7.26□□□□□ -1.25
SOP4P39543 THI73YLR004C 1572 nt7.25□□□□□ -1.25
SOP4P39543 SAM50YNL026W 1455 nt7.25□□□□□ -1.25
SOP4P39543 HXT8YJL214W 1710 nt7.25□□□□□ -1.25
SOP4P39543 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.25□□□□□ -1.25
SOP4P39543 RUP1YOR138C 2016 nt7.25□□□□□ -1.25
SOP4P39543 POB3YML069W 1659 nt7.25□□□□□ -1.25
SOP4P39543 NDE1YMR145C 1683 nt7.25□□□□□ -1.25
SOP4P39543 FRT1YOR324C 1809 nt7.24□□□□□ -1.25
SOP4P39543 AQR1YNL065W 1761 nt7.23□□□□□ -1.25
SOP4P39543 PDC6YGR087C 1692 nt7.23□□□□□ -1.25
SOP4P39543 YER137CYER137C 447 nt7.23□□□□□ -1.25
SOP4P39543 YLR280CYLR280C 351 nt7.23□□□□□ -1.25
SOP4P39543 MAL31YBR298C 1845 nt7.22□□□□□ -1.25
SOP4P39543 CPD1YGR247W 720 nt7.22□□□□□ -1.25
SOP4P39543 RCF2YNR018W 675 nt7.22□□□□□ -1.25
SOP4P39543 YKR018CYKR018C 2178 nt7.22□□□□□ -1.25
SOP4P39543 LEO1YOR123C 1395 nt7.21□□□□□ -1.25
SOP4P39543 PUP3YER094C 618 nt7.21□□□□□ -1.26
SOP4P39543 GNA1YFL017C 480 nt7.21□□□□□ -1.26
SOP4P39543 YLR349WYLR349W 507 nt7.21□□□□□ -1.26
SOP4P39543 YOR041CYOR041C 432 nt7.21□□□□□ -1.26
SOP4P39543 OCH1YGL038C 1443 nt7.2□□□□□ -1.26
SOP4P39543 HAM1YJR069C 594 nt7.2□□□□□ -1.26
SOP4P39543 YBL113CYBL113C 2379 nt7.2□□□□□ -1.26
SOP4P39543 CTF3YLR381W 2202 nt7.19□□□□□ -1.26
SOP4P39543 ADH7YCR105W 1086 nt7.19□□□□□ -1.26
SOP4P39543 FLX1YIL134W 936 nt7.19□□□□□ -1.26
SOP4P39543 AOS1YPR180W 1044 nt7.19□□□□□ -1.26
SOP4P39543 RPL12BYDR418W 498 nt7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 68.9 ms