Protein–RNA interactions for Protein: P35712

SOX6, Transcription factor SOX-6, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX6P35712 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX6P35712 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX6P35712 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX6P35712 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX6P35712 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX6P35712 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX6P35712 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX6P35712 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SOX6P35712 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SOX6P35712 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX6P35712 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX6P35712 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX6P35712 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX6P35712 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX6P35712 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX6P35712 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX6P35712 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX6P35712 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX6P35712 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX6P35712 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX6P35712 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX6P35712 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX6P35712 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX6P35712 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX6P35712 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX6P35712 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX6P35712 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX6P35712 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX6P35712 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX6P35712 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX6P35712 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX6P35712 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX6P35712 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX6P35712 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX6P35712 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX6P35712 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX6P35712 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX6P35712 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX6P35712 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX6P35712 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX6P35712 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX6P35712 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX6P35712 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX6P35712 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX6P35712 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX6P35712 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX6P35712 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX6P35712 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX6P35712 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX6P35712 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX6P35712 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX6P35712 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX6P35712 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX6P35712 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX6P35712 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX6P35712 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX6P35712 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX6P35712 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX6P35712 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX6P35712 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX6P35712 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX6P35712 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX6P35712 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX6P35712 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX6P35712 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX6P35712 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX6P35712 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX6P35712 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX6P35712 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX6P35712 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SOX6P35712 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SOX6P35712 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX6P35712 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX6P35712 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX6P35712 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX6P35712 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX6P35712 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX6P35712 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX6P35712 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX6P35712 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX6P35712 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX6P35712 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX6P35712 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX6P35712 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX6P35712 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX6P35712 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX6P35712 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX6P35712 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX6P35712 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX6P35712 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX6P35712 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX6P35712 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX6P35712 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOX6P35712 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOX6P35712 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOX6P35712 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOX6P35712 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOX6P35712 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SOX6P35712 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOX6P35712 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms