Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFC1P35251 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFC1P35251 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFC1P35251 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFC1P35251 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFC1P35251 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFC1P35251 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFC1P35251 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFC1P35251 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RFC1P35251 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RFC1P35251 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFC1P35251 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFC1P35251 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFC1P35251 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFC1P35251 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFC1P35251 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFC1P35251 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFC1P35251 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RFC1P35251 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
RFC1P35251 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RFC1P35251 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RFC1P35251 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RFC1P35251 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFC1P35251 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFC1P35251 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFC1P35251 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFC1P35251 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFC1P35251 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RFC1P35251 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RFC1P35251 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RFC1P35251 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RFC1P35251 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RFC1P35251 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RFC1P35251 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RFC1P35251 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RFC1P35251 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RFC1P35251 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RFC1P35251 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RFC1P35251 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RFC1P35251 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RFC1P35251 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RFC1P35251 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RFC1P35251 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RFC1P35251 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RFC1P35251 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RFC1P35251 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RFC1P35251 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RFC1P35251 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RFC1P35251 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RFC1P35251 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RFC1P35251 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RFC1P35251 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFC1P35251 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFC1P35251 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFC1P35251 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFC1P35251 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RFC1P35251 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RFC1P35251 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RFC1P35251 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFC1P35251 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFC1P35251 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFC1P35251 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RFC1P35251 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RFC1P35251 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RFC1P35251 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RFC1P35251 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RFC1P35251 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RFC1P35251 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RFC1P35251 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RFC1P35251 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RFC1P35251 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFC1P35251 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RFC1P35251 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFC1P35251 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RFC1P35251 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RFC1P35251 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFC1P35251 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFC1P35251 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFC1P35251 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFC1P35251 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RFC1P35251 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RFC1P35251 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RFC1P35251 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RFC1P35251 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RFC1P35251 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RFC1P35251 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RFC1P35251 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RFC1P35251 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFC1P35251 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFC1P35251 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFC1P35251 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFC1P35251 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFC1P35251 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFC1P35251 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFC1P35251 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFC1P35251 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFC1P35251 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFC1P35251 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFC1P35251 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFC1P35251 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 419.7 ms