Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RDXP35241 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RDXP35241 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RDXP35241 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RDXP35241 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RDXP35241 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RDXP35241 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RDXP35241 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RDXP35241 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RDXP35241 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RDXP35241 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RDXP35241 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RDXP35241 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RDXP35241 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RDXP35241 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RDXP35241 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RDXP35241 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RDXP35241 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RDXP35241 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RDXP35241 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RDXP35241 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RDXP35241 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RDXP35241 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RDXP35241 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RDXP35241 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RDXP35241 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RDXP35241 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RDXP35241 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RDXP35241 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RDXP35241 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RDXP35241 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RDXP35241 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RDXP35241 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RDXP35241 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RDXP35241 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RDXP35241 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RDXP35241 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RDXP35241 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RDXP35241 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RDXP35241 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RDXP35241 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RDXP35241 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RDXP35241 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RDXP35241 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RDXP35241 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RDXP35241 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RDXP35241 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RDXP35241 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RDXP35241 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RDXP35241 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RDXP35241 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RDXP35241 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RDXP35241 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RDXP35241 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RDXP35241 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RDXP35241 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RDXP35241 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RDXP35241 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RDXP35241 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RDXP35241 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RDXP35241 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RDXP35241 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RDXP35241 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RDXP35241 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RDXP35241 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RDXP35241 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RDXP35241 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RDXP35241 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RDXP35241 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RDXP35241 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RDXP35241 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RDXP35241 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RDXP35241 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RDXP35241 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RDXP35241 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RDXP35241 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RDXP35241 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RDXP35241 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RDXP35241 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RDXP35241 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RDXP35241 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RDXP35241 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RDXP35241 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RDXP35241 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RDXP35241 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RDXP35241 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RDXP35241 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RDXP35241 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RDXP35241 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RDXP35241 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RDXP35241 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RDXP35241 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RDXP35241 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RDXP35241 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RDXP35241 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RDXP35241 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RDXP35241 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RDXP35241 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RDXP35241 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RDXP35241 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms