Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GBP1P32455 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GBP1P32455 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GBP1P32455 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GBP1P32455 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GBP1P32455 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GBP1P32455 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GBP1P32455 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GBP1P32455 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GBP1P32455 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GBP1P32455 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GBP1P32455 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GBP1P32455 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GBP1P32455 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GBP1P32455 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GBP1P32455 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GBP1P32455 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GBP1P32455 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GBP1P32455 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GBP1P32455 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GBP1P32455 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GBP1P32455 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GBP1P32455 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GBP1P32455 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GBP1P32455 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GBP1P32455 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GBP1P32455 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GBP1P32455 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GBP1P32455 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GBP1P32455 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GBP1P32455 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GBP1P32455 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GBP1P32455 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GBP1P32455 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GBP1P32455 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GBP1P32455 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GBP1P32455 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GBP1P32455 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GBP1P32455 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GBP1P32455 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
GBP1P32455 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
GBP1P32455 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GBP1P32455 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GBP1P32455 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GBP1P32455 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GBP1P32455 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GBP1P32455 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GBP1P32455 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GBP1P32455 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GBP1P32455 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GBP1P32455 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GBP1P32455 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GBP1P32455 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GBP1P32455 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GBP1P32455 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GBP1P32455 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GBP1P32455 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GBP1P32455 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GBP1P32455 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GBP1P32455 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GBP1P32455 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GBP1P32455 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GBP1P32455 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GBP1P32455 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GBP1P32455 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GBP1P32455 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GBP1P32455 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GBP1P32455 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GBP1P32455 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GBP1P32455 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GBP1P32455 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GBP1P32455 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GBP1P32455 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GBP1P32455 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GBP1P32455 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GBP1P32455 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GBP1P32455 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GBP1P32455 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GBP1P32455 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GBP1P32455 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GBP1P32455 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GBP1P32455 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GBP1P32455 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GBP1P32455 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GBP1P32455 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GBP1P32455 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GBP1P32455 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GBP1P32455 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GBP1P32455 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GBP1P32455 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GBP1P32455 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GBP1P32455 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GBP1P32455 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GBP1P32455 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GBP1P32455 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GBP1P32455 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GBP1P32455 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GBP1P32455 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GBP1P32455 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GBP1P32455 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms