Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC8A1P32418 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC8A1P32418 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC8A1P32418 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC8A1P32418 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC8A1P32418 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC8A1P32418 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC8A1P32418 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC8A1P32418 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC8A1P32418 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC8A1P32418 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC8A1P32418 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC8A1P32418 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC8A1P32418 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC8A1P32418 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC8A1P32418 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC8A1P32418 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC8A1P32418 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC8A1P32418 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC8A1P32418 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC8A1P32418 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC8A1P32418 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC8A1P32418 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC8A1P32418 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC8A1P32418 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC8A1P32418 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC8A1P32418 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC8A1P32418 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC8A1P32418 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC8A1P32418 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC8A1P32418 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC8A1P32418 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC8A1P32418 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC8A1P32418 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC8A1P32418 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC8A1P32418 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC8A1P32418 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC8A1P32418 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC8A1P32418 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC8A1P32418 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC8A1P32418 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC8A1P32418 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC8A1P32418 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC8A1P32418 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC8A1P32418 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC8A1P32418 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC8A1P32418 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC8A1P32418 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC8A1P32418 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC8A1P32418 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC8A1P32418 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC8A1P32418 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC8A1P32418 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC8A1P32418 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC8A1P32418 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC8A1P32418 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC8A1P32418 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC8A1P32418 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC8A1P32418 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC8A1P32418 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC8A1P32418 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC8A1P32418 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC8A1P32418 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC8A1P32418 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC8A1P32418 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC8A1P32418 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC8A1P32418 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC8A1P32418 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC8A1P32418 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC8A1P32418 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC8A1P32418 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC8A1P32418 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC8A1P32418 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC8A1P32418 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC8A1P32418 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC8A1P32418 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC8A1P32418 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC8A1P32418 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC8A1P32418 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC8A1P32418 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC8A1P32418 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC8A1P32418 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC8A1P32418 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC8A1P32418 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
SLC8A1P32418 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC8A1P32418 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC8A1P32418 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC8A1P32418 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC8A1P32418 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC8A1P32418 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC8A1P32418 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC8A1P32418 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC8A1P32418 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC8A1P32418 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC8A1P32418 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC8A1P32418 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC8A1P32418 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC8A1P32418 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC8A1P32418 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC8A1P32418 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms