Protein–RNA interactions for Protein: P31431

SDC4, Syndecan-4, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDC4P31431 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SDC4P31431 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SDC4P31431 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SDC4P31431 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SDC4P31431 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SDC4P31431 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SDC4P31431 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SDC4P31431 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SDC4P31431 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SDC4P31431 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SDC4P31431 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SDC4P31431 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SDC4P31431 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SDC4P31431 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SDC4P31431 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SDC4P31431 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SDC4P31431 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SDC4P31431 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SDC4P31431 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SDC4P31431 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SDC4P31431 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SDC4P31431 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SDC4P31431 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SDC4P31431 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SDC4P31431 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SDC4P31431 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SDC4P31431 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SDC4P31431 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SDC4P31431 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SDC4P31431 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SDC4P31431 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SDC4P31431 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SDC4P31431 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SDC4P31431 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SDC4P31431 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SDC4P31431 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SDC4P31431 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SDC4P31431 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SDC4P31431 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SDC4P31431 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SDC4P31431 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SDC4P31431 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SDC4P31431 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SDC4P31431 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SDC4P31431 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SDC4P31431 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SDC4P31431 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SDC4P31431 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SDC4P31431 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SDC4P31431 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SDC4P31431 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SDC4P31431 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SDC4P31431 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SDC4P31431 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SDC4P31431 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SDC4P31431 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SDC4P31431 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SDC4P31431 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SDC4P31431 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SDC4P31431 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SDC4P31431 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SDC4P31431 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SDC4P31431 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SDC4P31431 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SDC4P31431 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SDC4P31431 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SDC4P31431 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SDC4P31431 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SDC4P31431 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SDC4P31431 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SDC4P31431 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SDC4P31431 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SDC4P31431 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SDC4P31431 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SDC4P31431 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SDC4P31431 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SDC4P31431 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SDC4P31431 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SDC4P31431 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SDC4P31431 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SDC4P31431 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SDC4P31431 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SDC4P31431 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SDC4P31431 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SDC4P31431 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SDC4P31431 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SDC4P31431 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SDC4P31431 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SDC4P31431 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SDC4P31431 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SDC4P31431 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SDC4P31431 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SDC4P31431 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SDC4P31431 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SDC4P31431 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SDC4P31431 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SDC4P31431 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SDC4P31431 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SDC4P31431 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SDC4P31431 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms