Protein–RNA interactions for Protein: P28476

GABRR2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-2, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR2P28476 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GABRR2P28476 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GABRR2P28476 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GABRR2P28476 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GABRR2P28476 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GABRR2P28476 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GABRR2P28476 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GABRR2P28476 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GABRR2P28476 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GABRR2P28476 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GABRR2P28476 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GABRR2P28476 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GABRR2P28476 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GABRR2P28476 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GABRR2P28476 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GABRR2P28476 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GABRR2P28476 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GABRR2P28476 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GABRR2P28476 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GABRR2P28476 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GABRR2P28476 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GABRR2P28476 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GABRR2P28476 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GABRR2P28476 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GABRR2P28476 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GABRR2P28476 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GABRR2P28476 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GABRR2P28476 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GABRR2P28476 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GABRR2P28476 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GABRR2P28476 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GABRR2P28476 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GABRR2P28476 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GABRR2P28476 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GABRR2P28476 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GABRR2P28476 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GABRR2P28476 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GABRR2P28476 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GABRR2P28476 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GABRR2P28476 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GABRR2P28476 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GABRR2P28476 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GABRR2P28476 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GABRR2P28476 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GABRR2P28476 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GABRR2P28476 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GABRR2P28476 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GABRR2P28476 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GABRR2P28476 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GABRR2P28476 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GABRR2P28476 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GABRR2P28476 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GABRR2P28476 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GABRR2P28476 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GABRR2P28476 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GABRR2P28476 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GABRR2P28476 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GABRR2P28476 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GABRR2P28476 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GABRR2P28476 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GABRR2P28476 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GABRR2P28476 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GABRR2P28476 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GABRR2P28476 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GABRR2P28476 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GABRR2P28476 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GABRR2P28476 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GABRR2P28476 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GABRR2P28476 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GABRR2P28476 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GABRR2P28476 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GABRR2P28476 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GABRR2P28476 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GABRR2P28476 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GABRR2P28476 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GABRR2P28476 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GABRR2P28476 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GABRR2P28476 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GABRR2P28476 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GABRR2P28476 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GABRR2P28476 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GABRR2P28476 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GABRR2P28476 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GABRR2P28476 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GABRR2P28476 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GABRR2P28476 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GABRR2P28476 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GABRR2P28476 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GABRR2P28476 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GABRR2P28476 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GABRR2P28476 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GABRR2P28476 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GABRR2P28476 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GABRR2P28476 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GABRR2P28476 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GABRR2P28476 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GABRR2P28476 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GABRR2P28476 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GABRR2P28476 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GABRR2P28476 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms