Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
YY1P25490 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
YY1P25490 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
YY1P25490 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
YY1P25490 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
YY1P25490 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
YY1P25490 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
YY1P25490 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
YY1P25490 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
YY1P25490 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
YY1P25490 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
YY1P25490 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
YY1P25490 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
YY1P25490 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
YY1P25490 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
YY1P25490 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
YY1P25490 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC32.27■■■□□ 2.76
YY1P25490 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
YY1P25490 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
YY1P25490 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
YY1P25490 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
YY1P25490 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
YY1P25490 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
YY1P25490 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
YY1P25490 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
YY1P25490 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
YY1P25490 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
YY1P25490 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
YY1P25490 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
YY1P25490 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
YY1P25490 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
YY1P25490 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
YY1P25490 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
YY1P25490 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
YY1P25490 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
YY1P25490 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
YY1P25490 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
YY1P25490 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
YY1P25490 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
YY1P25490 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
YY1P25490 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
YY1P25490 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
YY1P25490 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
YY1P25490 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
YY1P25490 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
YY1P25490 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
YY1P25490 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
YY1P25490 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
YY1P25490 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
YY1P25490 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
YY1P25490 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
YY1P25490 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
YY1P25490 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
YY1P25490 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
YY1P25490 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
YY1P25490 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
YY1P25490 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
YY1P25490 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
YY1P25490 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
YY1P25490 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
YY1P25490 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
YY1P25490 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
YY1P25490 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
YY1P25490 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
YY1P25490 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
YY1P25490 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
YY1P25490 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
YY1P25490 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
YY1P25490 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
YY1P25490 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
YY1P25490 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
YY1P25490 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
YY1P25490 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
YY1P25490 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
YY1P25490 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
YY1P25490 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
YY1P25490 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
YY1P25490 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
YY1P25490 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
YY1P25490 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
YY1P25490 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
YY1P25490 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
YY1P25490 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
YY1P25490 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
YY1P25490 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
YY1P25490 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
YY1P25490 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
YY1P25490 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
YY1P25490 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
YY1P25490 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
YY1P25490 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
YY1P25490 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
YY1P25490 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
YY1P25490 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
YY1P25490 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
YY1P25490 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
YY1P25490 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
YY1P25490 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
YY1P25490 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
YY1P25490 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms