Protein–RNA interactions for Protein: P23258

TUBG1, Tubulin gamma-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG1P23258 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBG1P23258 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBG1P23258 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBG1P23258 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBG1P23258 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBG1P23258 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBG1P23258 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBG1P23258 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBG1P23258 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBG1P23258 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBG1P23258 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBG1P23258 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBG1P23258 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBG1P23258 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBG1P23258 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBG1P23258 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBG1P23258 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBG1P23258 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBG1P23258 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBG1P23258 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBG1P23258 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBG1P23258 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBG1P23258 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBG1P23258 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBG1P23258 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBG1P23258 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBG1P23258 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBG1P23258 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBG1P23258 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBG1P23258 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBG1P23258 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBG1P23258 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBG1P23258 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBG1P23258 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBG1P23258 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBG1P23258 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBG1P23258 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBG1P23258 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBG1P23258 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBG1P23258 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBG1P23258 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBG1P23258 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBG1P23258 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBG1P23258 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBG1P23258 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBG1P23258 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBG1P23258 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBG1P23258 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBG1P23258 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBG1P23258 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBG1P23258 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBG1P23258 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBG1P23258 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBG1P23258 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBG1P23258 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBG1P23258 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBG1P23258 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBG1P23258 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBG1P23258 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBG1P23258 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBG1P23258 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBG1P23258 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBG1P23258 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBG1P23258 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBG1P23258 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBG1P23258 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBG1P23258 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBG1P23258 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBG1P23258 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TUBG1P23258 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBG1P23258 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBG1P23258 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBG1P23258 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBG1P23258 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBG1P23258 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBG1P23258 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBG1P23258 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBG1P23258 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBG1P23258 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBG1P23258 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBG1P23258 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBG1P23258 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBG1P23258 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBG1P23258 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBG1P23258 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBG1P23258 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBG1P23258 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBG1P23258 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBG1P23258 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBG1P23258 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBG1P23258 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBG1P23258 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBG1P23258 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBG1P23258 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBG1P23258 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBG1P23258 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBG1P23258 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBG1P23258 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBG1P23258 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBG1P23258 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms