Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
VCAM1P19320 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
VCAM1P19320 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
VCAM1P19320 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
VCAM1P19320 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
VCAM1P19320 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
VCAM1P19320 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
VCAM1P19320 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
VCAM1P19320 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
VCAM1P19320 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
VCAM1P19320 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
VCAM1P19320 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
VCAM1P19320 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
VCAM1P19320 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
VCAM1P19320 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
VCAM1P19320 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
VCAM1P19320 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
VCAM1P19320 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
VCAM1P19320 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
VCAM1P19320 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
VCAM1P19320 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
VCAM1P19320 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
VCAM1P19320 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
VCAM1P19320 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
VCAM1P19320 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
VCAM1P19320 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
VCAM1P19320 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
VCAM1P19320 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
VCAM1P19320 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
VCAM1P19320 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
VCAM1P19320 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
VCAM1P19320 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
VCAM1P19320 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
VCAM1P19320 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
VCAM1P19320 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
VCAM1P19320 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
VCAM1P19320 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
VCAM1P19320 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
VCAM1P19320 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VCAM1P19320 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VCAM1P19320 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
VCAM1P19320 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
VCAM1P19320 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
VCAM1P19320 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
VCAM1P19320 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
VCAM1P19320 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
VCAM1P19320 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
VCAM1P19320 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
VCAM1P19320 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
VCAM1P19320 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
VCAM1P19320 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
VCAM1P19320 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
VCAM1P19320 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
VCAM1P19320 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
VCAM1P19320 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
VCAM1P19320 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
VCAM1P19320 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
VCAM1P19320 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
VCAM1P19320 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
VCAM1P19320 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
VCAM1P19320 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
VCAM1P19320 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
VCAM1P19320 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
VCAM1P19320 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
VCAM1P19320 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
VCAM1P19320 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
VCAM1P19320 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
VCAM1P19320 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
VCAM1P19320 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
VCAM1P19320 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
VCAM1P19320 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
VCAM1P19320 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
VCAM1P19320 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
VCAM1P19320 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
VCAM1P19320 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
VCAM1P19320 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
VCAM1P19320 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
VCAM1P19320 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
VCAM1P19320 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
VCAM1P19320 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
VCAM1P19320 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
VCAM1P19320 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
VCAM1P19320 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
VCAM1P19320 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
VCAM1P19320 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
VCAM1P19320 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
VCAM1P19320 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
VCAM1P19320 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
VCAM1P19320 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
VCAM1P19320 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
VCAM1P19320 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
VCAM1P19320 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
VCAM1P19320 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
VCAM1P19320 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
VCAM1P19320 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
VCAM1P19320 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
VCAM1P19320 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
VCAM1P19320 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
VCAM1P19320 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
VCAM1P19320 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms