Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ATF3P18847 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ATF3P18847 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ATF3P18847 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ATF3P18847 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ATF3P18847 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ATF3P18847 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ATF3P18847 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ATF3P18847 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
ATF3P18847 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
ATF3P18847 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ATF3P18847 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ATF3P18847 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ATF3P18847 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ATF3P18847 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ATF3P18847 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ATF3P18847 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ATF3P18847 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ATF3P18847 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ATF3P18847 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ATF3P18847 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ATF3P18847 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ATF3P18847 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ATF3P18847 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ATF3P18847 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ATF3P18847 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ATF3P18847 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ATF3P18847 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ATF3P18847 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
ATF3P18847 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ATF3P18847 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
ATF3P18847 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
ATF3P18847 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ATF3P18847 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ATF3P18847 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ATF3P18847 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ATF3P18847 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ATF3P18847 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ATF3P18847 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
ATF3P18847 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ATF3P18847 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ATF3P18847 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ATF3P18847 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ATF3P18847 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ATF3P18847 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ATF3P18847 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ATF3P18847 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ATF3P18847 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ATF3P18847 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
ATF3P18847 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
ATF3P18847 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ATF3P18847 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ATF3P18847 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ATF3P18847 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ATF3P18847 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ATF3P18847 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ATF3P18847 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
ATF3P18847 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ATF3P18847 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ATF3P18847 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ATF3P18847 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ATF3P18847 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ATF3P18847 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
ATF3P18847 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ATF3P18847 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
ATF3P18847 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ATF3P18847 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ATF3P18847 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ATF3P18847 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ATF3P18847 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ATF3P18847 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ATF3P18847 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
ATF3P18847 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
ATF3P18847 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
ATF3P18847 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ATF3P18847 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
ATF3P18847 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
ATF3P18847 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ATF3P18847 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ATF3P18847 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ATF3P18847 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ATF3P18847 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ATF3P18847 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ATF3P18847 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
ATF3P18847 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ATF3P18847 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
ATF3P18847 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
ATF3P18847 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
ATF3P18847 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
ATF3P18847 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ATF3P18847 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
ATF3P18847 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
ATF3P18847 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
ATF3P18847 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ATF3P18847 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ATF3P18847 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ATF3P18847 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
ATF3P18847 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
ATF3P18847 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
ATF3P18847 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms