Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AMD1P17707 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AMD1P17707 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AMD1P17707 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AMD1P17707 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AMD1P17707 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
AMD1P17707 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AMD1P17707 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AMD1P17707 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AMD1P17707 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AMD1P17707 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AMD1P17707 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AMD1P17707 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AMD1P17707 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AMD1P17707 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AMD1P17707 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AMD1P17707 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AMD1P17707 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AMD1P17707 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AMD1P17707 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AMD1P17707 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AMD1P17707 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AMD1P17707 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AMD1P17707 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AMD1P17707 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AMD1P17707 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AMD1P17707 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AMD1P17707 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
AMD1P17707 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AMD1P17707 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AMD1P17707 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AMD1P17707 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
AMD1P17707 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AMD1P17707 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
AMD1P17707 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AMD1P17707 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AMD1P17707 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AMD1P17707 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
AMD1P17707 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
AMD1P17707 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
AMD1P17707 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
AMD1P17707 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
AMD1P17707 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
AMD1P17707 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
AMD1P17707 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
AMD1P17707 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
AMD1P17707 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AMD1P17707 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
AMD1P17707 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AMD1P17707 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AMD1P17707 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AMD1P17707 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AMD1P17707 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AMD1P17707 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AMD1P17707 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AMD1P17707 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AMD1P17707 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AMD1P17707 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AMD1P17707 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AMD1P17707 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
AMD1P17707 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AMD1P17707 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AMD1P17707 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AMD1P17707 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AMD1P17707 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AMD1P17707 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AMD1P17707 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AMD1P17707 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AMD1P17707 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AMD1P17707 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AMD1P17707 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AMD1P17707 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AMD1P17707 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AMD1P17707 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AMD1P17707 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AMD1P17707 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AMD1P17707 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AMD1P17707 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AMD1P17707 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
AMD1P17707 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AMD1P17707 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AMD1P17707 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AMD1P17707 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AMD1P17707 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AMD1P17707 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AMD1P17707 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AMD1P17707 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
AMD1P17707 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AMD1P17707 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
AMD1P17707 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AMD1P17707 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AMD1P17707 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AMD1P17707 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AMD1P17707 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AMD1P17707 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AMD1P17707 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AMD1P17707 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AMD1P17707 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AMD1P17707 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AMD1P17707 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms