Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCL3L1P16619 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCL3L1P16619 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCL3L1P16619 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCL3L1P16619 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCL3L1P16619 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCL3L1P16619 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCL3L1P16619 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCL3L1P16619 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCL3L1P16619 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCL3L1P16619 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCL3L1P16619 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCL3L1P16619 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCL3L1P16619 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCL3L1P16619 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCL3L1P16619 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCL3L1P16619 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCL3L1P16619 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCL3L1P16619 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCL3L1P16619 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCL3L1P16619 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCL3L1P16619 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCL3L1P16619 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCL3L1P16619 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCL3L1P16619 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCL3L1P16619 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCL3L1P16619 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCL3L1P16619 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCL3L1P16619 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCL3L1P16619 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCL3L1P16619 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCL3L1P16619 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCL3L1P16619 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCL3L1P16619 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCL3L1P16619 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCL3L1P16619 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCL3L1P16619 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL3L1P16619 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL3L1P16619 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL3L1P16619 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL3L1P16619 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL3L1P16619 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL3L1P16619 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL3L1P16619 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL3L1P16619 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL3L1P16619 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL3L1P16619 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL3L1P16619 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL3L1P16619 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCL3L1P16619 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCL3L1P16619 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCL3L1P16619 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCL3L1P16619 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL3L1P16619 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL3L1P16619 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL3L1P16619 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL3L1P16619 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL3L1P16619 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL3L1P16619 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL3L1P16619 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL3L1P16619 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL3L1P16619 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCL3L1P16619 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCL3L1P16619 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCL3L1P16619 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCL3L1P16619 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCL3L1P16619 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCL3L1P16619 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCL3L1P16619 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCL3L1P16619 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCL3L1P16619 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCL3L1P16619 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCL3L1P16619 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCL3L1P16619 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCL3L1P16619 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCL3L1P16619 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCL3L1P16619 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCL3L1P16619 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCL3L1P16619 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCL3L1P16619 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCL3L1P16619 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCL3L1P16619 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCL3L1P16619 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCL3L1P16619 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCL3L1P16619 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCL3L1P16619 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCL3L1P16619 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCL3L1P16619 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCL3L1P16619 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCL3L1P16619 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCL3L1P16619 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCL3L1P16619 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCL3L1P16619 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCL3L1P16619 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCL3L1P16619 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCL3L1P16619 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCL3L1P16619 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCL3L1P16619 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCL3L1P16619 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCL3L1P16619 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.3 ms