Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
EPCAMP16422 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EPCAMP16422 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
EPCAMP16422 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPCAMP16422 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPCAMP16422 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPCAMP16422 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPCAMP16422 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EPCAMP16422 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EPCAMP16422 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EPCAMP16422 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EPCAMP16422 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EPCAMP16422 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
EPCAMP16422 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EPCAMP16422 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EPCAMP16422 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EPCAMP16422 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EPCAMP16422 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EPCAMP16422 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EPCAMP16422 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EPCAMP16422 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EPCAMP16422 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EPCAMP16422 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EPCAMP16422 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EPCAMP16422 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EPCAMP16422 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EPCAMP16422 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EPCAMP16422 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EPCAMP16422 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EPCAMP16422 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EPCAMP16422 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EPCAMP16422 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EPCAMP16422 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EPCAMP16422 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EPCAMP16422 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
EPCAMP16422 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
EPCAMP16422 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EPCAMP16422 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EPCAMP16422 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EPCAMP16422 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EPCAMP16422 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EPCAMP16422 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EPCAMP16422 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EPCAMP16422 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EPCAMP16422 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EPCAMP16422 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EPCAMP16422 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EPCAMP16422 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EPCAMP16422 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EPCAMP16422 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EPCAMP16422 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
EPCAMP16422 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EPCAMP16422 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EPCAMP16422 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
EPCAMP16422 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
EPCAMP16422 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EPCAMP16422 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
EPCAMP16422 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EPCAMP16422 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EPCAMP16422 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EPCAMP16422 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EPCAMP16422 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EPCAMP16422 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EPCAMP16422 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EPCAMP16422 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
EPCAMP16422 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EPCAMP16422 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EPCAMP16422 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
EPCAMP16422 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EPCAMP16422 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
EPCAMP16422 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EPCAMP16422 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EPCAMP16422 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EPCAMP16422 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EPCAMP16422 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EPCAMP16422 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EPCAMP16422 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EPCAMP16422 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EPCAMP16422 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
EPCAMP16422 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EPCAMP16422 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EPCAMP16422 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EPCAMP16422 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EPCAMP16422 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EPCAMP16422 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EPCAMP16422 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
EPCAMP16422 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EPCAMP16422 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EPCAMP16422 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EPCAMP16422 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EPCAMP16422 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EPCAMP16422 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EPCAMP16422 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EPCAMP16422 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EPCAMP16422 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EPCAMP16422 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
EPCAMP16422 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
EPCAMP16422 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
EPCAMP16422 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EPCAMP16422 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms