Protein–RNA interactions for Protein: P15918

RAG1, V(D)J recombination-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG1P15918 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAG1P15918 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAG1P15918 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAG1P15918 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAG1P15918 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAG1P15918 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAG1P15918 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAG1P15918 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAG1P15918 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAG1P15918 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RAG1P15918 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAG1P15918 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RAG1P15918 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAG1P15918 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAG1P15918 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
RAG1P15918 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RAG1P15918 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RAG1P15918 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RAG1P15918 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAG1P15918 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RAG1P15918 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAG1P15918 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAG1P15918 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAG1P15918 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAG1P15918 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAG1P15918 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAG1P15918 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAG1P15918 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAG1P15918 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAG1P15918 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAG1P15918 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAG1P15918 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAG1P15918 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAG1P15918 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RAG1P15918 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAG1P15918 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAG1P15918 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RAG1P15918 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RAG1P15918 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RAG1P15918 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAG1P15918 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAG1P15918 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAG1P15918 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAG1P15918 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAG1P15918 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAG1P15918 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAG1P15918 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAG1P15918 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAG1P15918 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAG1P15918 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAG1P15918 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAG1P15918 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAG1P15918 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAG1P15918 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAG1P15918 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RAG1P15918 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAG1P15918 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAG1P15918 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAG1P15918 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RAG1P15918 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAG1P15918 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAG1P15918 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAG1P15918 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAG1P15918 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAG1P15918 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RAG1P15918 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAG1P15918 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAG1P15918 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAG1P15918 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAG1P15918 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAG1P15918 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAG1P15918 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RAG1P15918 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RAG1P15918 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAG1P15918 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RAG1P15918 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAG1P15918 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAG1P15918 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAG1P15918 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RAG1P15918 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAG1P15918 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAG1P15918 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RAG1P15918 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RAG1P15918 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAG1P15918 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAG1P15918 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAG1P15918 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAG1P15918 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAG1P15918 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAG1P15918 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAG1P15918 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAG1P15918 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAG1P15918 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAG1P15918 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAG1P15918 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAG1P15918 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RAG1P15918 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAG1P15918 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RAG1P15918 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAG1P15918 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms