Protein–RNA interactions for Protein: P14854

COX6B1, Cytochrome c oxidase subunit 6B1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6B1P14854 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COX6B1P14854 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COX6B1P14854 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COX6B1P14854 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COX6B1P14854 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COX6B1P14854 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COX6B1P14854 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COX6B1P14854 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COX6B1P14854 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COX6B1P14854 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COX6B1P14854 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COX6B1P14854 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COX6B1P14854 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COX6B1P14854 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COX6B1P14854 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COX6B1P14854 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COX6B1P14854 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COX6B1P14854 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COX6B1P14854 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COX6B1P14854 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COX6B1P14854 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COX6B1P14854 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COX6B1P14854 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COX6B1P14854 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COX6B1P14854 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COX6B1P14854 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COX6B1P14854 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COX6B1P14854 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX6B1P14854 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX6B1P14854 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX6B1P14854 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX6B1P14854 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COX6B1P14854 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COX6B1P14854 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COX6B1P14854 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COX6B1P14854 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COX6B1P14854 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COX6B1P14854 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COX6B1P14854 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COX6B1P14854 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COX6B1P14854 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
COX6B1P14854 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COX6B1P14854 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COX6B1P14854 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COX6B1P14854 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
COX6B1P14854 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COX6B1P14854 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
COX6B1P14854 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COX6B1P14854 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COX6B1P14854 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COX6B1P14854 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COX6B1P14854 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COX6B1P14854 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COX6B1P14854 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COX6B1P14854 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX6B1P14854 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX6B1P14854 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX6B1P14854 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COX6B1P14854 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX6B1P14854 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX6B1P14854 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COX6B1P14854 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
COX6B1P14854 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COX6B1P14854 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COX6B1P14854 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COX6B1P14854 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COX6B1P14854 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COX6B1P14854 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COX6B1P14854 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COX6B1P14854 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COX6B1P14854 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COX6B1P14854 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COX6B1P14854 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COX6B1P14854 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COX6B1P14854 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COX6B1P14854 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
COX6B1P14854 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COX6B1P14854 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COX6B1P14854 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COX6B1P14854 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COX6B1P14854 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COX6B1P14854 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
COX6B1P14854 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX6B1P14854 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX6B1P14854 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX6B1P14854 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX6B1P14854 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX6B1P14854 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX6B1P14854 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms