Protein–RNA interactions for Protein: P14652

HOXB2, Homeobox protein Hox-B2, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB2P14652 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXB2P14652 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXB2P14652 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXB2P14652 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXB2P14652 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXB2P14652 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXB2P14652 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXB2P14652 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXB2P14652 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXB2P14652 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXB2P14652 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXB2P14652 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXB2P14652 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXB2P14652 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXB2P14652 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXB2P14652 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXB2P14652 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXB2P14652 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXB2P14652 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXB2P14652 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXB2P14652 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXB2P14652 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXB2P14652 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXB2P14652 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXB2P14652 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXB2P14652 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXB2P14652 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXB2P14652 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXB2P14652 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXB2P14652 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXB2P14652 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXB2P14652 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXB2P14652 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXB2P14652 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXB2P14652 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXB2P14652 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXB2P14652 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXB2P14652 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXB2P14652 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXB2P14652 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXB2P14652 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXB2P14652 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXB2P14652 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXB2P14652 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXB2P14652 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXB2P14652 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXB2P14652 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXB2P14652 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXB2P14652 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HOXB2P14652 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HOXB2P14652 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HOXB2P14652 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXB2P14652 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXB2P14652 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXB2P14652 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXB2P14652 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXB2P14652 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXB2P14652 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXB2P14652 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXB2P14652 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXB2P14652 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXB2P14652 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXB2P14652 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXB2P14652 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXB2P14652 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXB2P14652 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXB2P14652 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXB2P14652 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXB2P14652 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXB2P14652 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXB2P14652 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXB2P14652 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXB2P14652 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXB2P14652 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXB2P14652 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXB2P14652 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXB2P14652 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXB2P14652 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXB2P14652 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXB2P14652 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXB2P14652 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXB2P14652 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXB2P14652 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXB2P14652 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXB2P14652 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXB2P14652 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXB2P14652 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXB2P14652 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXB2P14652 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXB2P14652 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXB2P14652 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXB2P14652 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXB2P14652 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXB2P14652 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXB2P14652 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXB2P14652 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXB2P14652 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXB2P14652 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXB2P14652 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXB2P14652 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms