Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF35P13682 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF35P13682 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF35P13682 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF35P13682 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF35P13682 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF35P13682 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF35P13682 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF35P13682 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF35P13682 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF35P13682 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF35P13682 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF35P13682 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF35P13682 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF35P13682 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF35P13682 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF35P13682 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF35P13682 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF35P13682 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF35P13682 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF35P13682 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF35P13682 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF35P13682 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF35P13682 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF35P13682 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF35P13682 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF35P13682 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF35P13682 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF35P13682 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZNF35P13682 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
ZNF35P13682 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF35P13682 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF35P13682 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF35P13682 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF35P13682 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF35P13682 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF35P13682 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF35P13682 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF35P13682 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF35P13682 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF35P13682 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF35P13682 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF35P13682 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF35P13682 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF35P13682 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF35P13682 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF35P13682 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF35P13682 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF35P13682 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF35P13682 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF35P13682 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF35P13682 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF35P13682 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF35P13682 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF35P13682 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF35P13682 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF35P13682 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF35P13682 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF35P13682 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF35P13682 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF35P13682 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF35P13682 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF35P13682 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF35P13682 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF35P13682 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF35P13682 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF35P13682 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF35P13682 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF35P13682 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF35P13682 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF35P13682 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF35P13682 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF35P13682 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF35P13682 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF35P13682 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF35P13682 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF35P13682 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF35P13682 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF35P13682 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF35P13682 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF35P13682 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF35P13682 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF35P13682 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF35P13682 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF35P13682 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF35P13682 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF35P13682 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF35P13682 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF35P13682 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF35P13682 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF35P13682 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF35P13682 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF35P13682 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF35P13682 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF35P13682 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF35P13682 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF35P13682 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF35P13682 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF35P13682 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF35P13682 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms