Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ESRRAP11474 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ESRRAP11474 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ESRRAP11474 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ESRRAP11474 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ESRRAP11474 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ESRRAP11474 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ESRRAP11474 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ESRRAP11474 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ESRRAP11474 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ESRRAP11474 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ESRRAP11474 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ESRRAP11474 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ESRRAP11474 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ESRRAP11474 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ESRRAP11474 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ESRRAP11474 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ESRRAP11474 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ESRRAP11474 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ESRRAP11474 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ESRRAP11474 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ESRRAP11474 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ESRRAP11474 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ESRRAP11474 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ESRRAP11474 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ESRRAP11474 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ESRRAP11474 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ESRRAP11474 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ESRRAP11474 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ESRRAP11474 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ESRRAP11474 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ESRRAP11474 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ESRRAP11474 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ESRRAP11474 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ESRRAP11474 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ESRRAP11474 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ESRRAP11474 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ESRRAP11474 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ESRRAP11474 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ESRRAP11474 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ESRRAP11474 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ESRRAP11474 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ESRRAP11474 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ESRRAP11474 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ESRRAP11474 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ESRRAP11474 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ESRRAP11474 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ESRRAP11474 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ESRRAP11474 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ESRRAP11474 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ESRRAP11474 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ESRRAP11474 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ESRRAP11474 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ESRRAP11474 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ESRRAP11474 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ESRRAP11474 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ESRRAP11474 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ESRRAP11474 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ESRRAP11474 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ESRRAP11474 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ESRRAP11474 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ESRRAP11474 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ESRRAP11474 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ESRRAP11474 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ESRRAP11474 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ESRRAP11474 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ESRRAP11474 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ESRRAP11474 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ESRRAP11474 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ESRRAP11474 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ESRRAP11474 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ESRRAP11474 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ESRRAP11474 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ESRRAP11474 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ESRRAP11474 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ESRRAP11474 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ESRRAP11474 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ESRRAP11474 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ESRRAP11474 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ESRRAP11474 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ESRRAP11474 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ESRRAP11474 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ESRRAP11474 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ESRRAP11474 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ESRRAP11474 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ESRRAP11474 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ESRRAP11474 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ESRRAP11474 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ESRRAP11474 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ESRRAP11474 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ESRRAP11474 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ESRRAP11474 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ESRRAP11474 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ESRRAP11474 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ESRRAP11474 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ESRRAP11474 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ESRRAP11474 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ESRRAP11474 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ESRRAP11474 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ESRRAP11474 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms