Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBL4AP11441 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBL4AP11441 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBL4AP11441 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBL4AP11441 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBL4AP11441 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBL4AP11441 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBL4AP11441 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBL4AP11441 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBL4AP11441 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBL4AP11441 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBL4AP11441 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBL4AP11441 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBL4AP11441 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBL4AP11441 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBL4AP11441 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBL4AP11441 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UBL4AP11441 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBL4AP11441 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBL4AP11441 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBL4AP11441 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBL4AP11441 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBL4AP11441 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBL4AP11441 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBL4AP11441 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBL4AP11441 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UBL4AP11441 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBL4AP11441 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBL4AP11441 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UBL4AP11441 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBL4AP11441 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBL4AP11441 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBL4AP11441 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBL4AP11441 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBL4AP11441 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBL4AP11441 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBL4AP11441 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBL4AP11441 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBL4AP11441 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBL4AP11441 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBL4AP11441 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBL4AP11441 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBL4AP11441 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
UBL4AP11441 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBL4AP11441 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBL4AP11441 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UBL4AP11441 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBL4AP11441 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBL4AP11441 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UBL4AP11441 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBL4AP11441 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBL4AP11441 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBL4AP11441 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBL4AP11441 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBL4AP11441 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UBL4AP11441 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBL4AP11441 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBL4AP11441 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBL4AP11441 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBL4AP11441 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBL4AP11441 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBL4AP11441 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBL4AP11441 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBL4AP11441 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBL4AP11441 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBL4AP11441 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UBL4AP11441 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBL4AP11441 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBL4AP11441 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBL4AP11441 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBL4AP11441 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBL4AP11441 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBL4AP11441 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBL4AP11441 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBL4AP11441 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBL4AP11441 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBL4AP11441 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBL4AP11441 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBL4AP11441 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBL4AP11441 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBL4AP11441 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBL4AP11441 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBL4AP11441 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBL4AP11441 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UBL4AP11441 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBL4AP11441 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBL4AP11441 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBL4AP11441 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBL4AP11441 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBL4AP11441 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBL4AP11441 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBL4AP11441 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBL4AP11441 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBL4AP11441 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBL4AP11441 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBL4AP11441 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBL4AP11441 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBL4AP11441 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBL4AP11441 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBL4AP11441 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.7 ms